dendrogram

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私の仕事ではthis postのデンドログラムを使っていますが、どの行/列がどのデータから来ているのかを把握したいと思っています。データの名前のレコードをコードとして編集しました。namesとして以下のように編集しました。距離行列の視覚化の右下に名前を表示したいと思います。私はdendrogramへの呼び出しでlabels = namesを追加しようとしましたが、これは役に立ちませんでした。こ

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Rでマイニングされたテキストのクラスタがあいまいになっているのはなぜですか？

質問：テキストマイニングデータのクラスタ樹形図がぼやけて/乱雑になっているのはなぜですか（下の図のリンクを参照）。概要：私は最初にMongoデータベースから約5500件の電子スキャンされた記事のオリジナルデータを収集し、ディスクドライブにJsonオブジェクトとして保存しました（ここでは表示されていません。RのCran Mongoliteパッケージを使用して収穫しました）。ここに示されているのは、

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異なる高さクラスタ系統樹iはd3.js について質問があり

をd3.jsに私が実行されている。この基本的な例があります：私のjavascriptのコードはここにある { "name": "root", "children": [ { "name": "parent A", "children": [ {"name": "child A1"}, {"name": "child A2"}

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C＃の樹形図

私はC＃でAGNES（凝集クラスタリングアルゴリズム）のバージョンを実装しましたが、私は樹状図を実装するのに苦労しています。私はtreeviewコンポーネントを使ってバイナリツリーを実装しましたが、マイクロアレイの遺伝子発現データを解析するための "本当の"樹形図を作成する必要があります。私は.NET（RとPythonにはたくさんあります）で樹形図コンポーネントを見つけることができず、GDI +を

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seaborn clustermapからクラスタを抽出する

私はseaborn clustermapを使用してクラスタを作成しており、視覚的にはうまくいきます（exampleは非常に似た結果を出します）。しかし、プログラムでクラスターを抽出する方法がわかりません。例えば、リンクの例では、1-1 rh、1-1 lh、5-1 rh、5-1 lhが良いクラスタを作ることがわかりましたか？視覚的には簡単です。 import pandas as pd impor

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rで樹状図ラベルを変更するには

私はRで樹形図を持っています。これはhclustを使った階層的クラスタリングに基づいています。私は異なる色で異なるラベルに色付けしていますが、dendrogram = dendrogram %>% set("labels", dataframe$column)を使用して私の専用プログラムのラベルを（データフレームの行に）変更しようとすると、ラベルは置き換えられますが、間違った位置にあります。例とし

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ヒートマップからデンドログラムを抽出中にエラーが発生しました

ヒートマップをヒートマップから作成し、ヒートマップからデンドログラムを抽出し、デンドログラムをnewickファイル形式で保存しようとしています。マトリックスは、列上のゲノムおよび列上の遺伝子を有する。これを行うには、次のコードを実行しています。私はそれ意志の完全プロフィールで実行しようとすると、 library(ggdendro) library(ape) library(gplots)

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外部のラベルに基づく樹状図の色分けは、ラベルが一致するまで根元から上方に移動します

質問Color branches of dendrogram using an existing columnから、私は樹状図の葉の近くの枝に色を付けることができます。コード：に示すように x<-1:100 dim(x)<-c(10,10) set.seed(1) groups<-c("red","red", "red", "red", "blue", "blue", "blue","blu

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は、私は、このように<code>ggdendro</code>を使用して系統樹を作成

クラスタを樹形図や色にラベルを追加マイネットワークは次のとおりです。 > dput(net) structure(list(77, FALSE, c(1, 2, 3, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 11, 11, 11, 11, 12, 13, 14, 15, 17, 18, 18, 19, 19, 19, 20, 20, 20, 20, 21, 21, 21, 21, 21,

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表示TraMineR（R）は、私がTraMineR配列に基づいてラベルで（添付画像を参照）樹状図を生成するために、以下のRコードを使用

テキスト/テーブル形式で樹状hereを見つけることができます。デンドログラムと同様にグラフィカルに表示されるので、テキストや表形式で同じ情報を取得すると便利です。私が "order"や "merge"のようにオブジェクトの側面を（agnesによって作成された）クラスタで呼び出すと、私はcolnames(twitter_sequences)から得た名前ではなく、数字を使ってラベル付けされています。