dendrogram

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グラフでクラスタリングの問題を解決するアルゴリズムを実装しました。私はグラフを表現するためにpythonライブラリ "python-graph"を使用しました。さて、私の計算の各段階（アルゴリズムは反復的です）で、私は樹状図の一部を描く必要があります。実際のところ、このアルゴリズムは、元のグラフから開始するとクラスタを計算するという意味では分かれています。今、私は樹状図を描くために何を使うべきかわ

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LAMPを使ったクラスタ分析

私はいくつかのデータクラスタ分析を行う方法を探しています。これは私のリーグの方法ですが、私はそれができることを知っています。私は持っているデータをクラスター化して視覚的に提示する方法を探しています。頭に浮かぶのはデンドログラムですが、私は他の提案にもオープンしています。このタスクで私を助けてくれるスクリプトやクラスがありますか？私はLAMP内にとどまることを好む。ありがとうございました。

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デンドログラムをプロットするためのライブラリまたはAPI

私はいくつかのデータを含むMySQLデータベースを持っており、JSPページとやりとりします。データベースに格納されたさまざまなファイルから樹形図をプロットする必要があります。 JTreeなどのJava APIをいくつか見つけましたが、Javaには慣れていないので、CGIやPHPページでプログラムやその他のものを呼び出す方法があるのだろうかと思います。ご意見やご提案は大歓迎です。これは、多くのヶ月

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樹形図の関数の戻りベクトル

私はMATLABの文書によると、以下の [h1,t1,perm1] = dendrogram(z,3); のようなMATLAB関数を使用して系統樹を描いていますについては、返さh1は、樹状図の行へのハンドルのベクトルです。私はそれが意味することを知らない。私の場合は、戻りh1は H1このベクトルを使用する方法= 174.0048 175.0043 のですか？

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ピアソン距離を使用したマイクロアレイデータのヒートマップ

私はいくつかのマイクロアレイデータのRでヒートマップを生成しようとしており、大部分はオンライン命令に基づいて1つを作成するのに成功していますが、。私が望むのは、ユークリッド距離ではなくピアソン距離に基づいてデータをクラスタリングすることですが、私はいくつかの困難に苦しんでいます。 heatmap.2(Test402,trace="none",density="none",scale="row",

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Rをツリーの樹形図に変換するには？

ツリー（Javaプログラムの出力）をRの樹形図に変換するにはどうすればよいですか？現在、私はhereの提案を使用して、ツリーをNewick形式に変換しています。そして私はNewickのフォーマットのツリーを読み取るためにRにapeパッケージを使用します。 library("ape") cPhylo <- read.tree(file = "gc.tree") は最後に、私は、樹状図の中に木

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Rのデンドログラムでは、エッジの色を付けたり、矩形を正しく描くにはどうしたらいいですか？

Rはhclust(),as.dendrogram()およびplot.dendrogram()の関数を使用してthis dendrogramを生成しました。私はdendrapply()関数を使用してローカルな関数を使って葉を色づけしました。これは問題なく動作しています。 Iは、（ツリーの右下隅に「_+v\_stat5a\_01_」の例えばクラスタと「_+v\_stat5b\_01_」）ノードのセッ