dendrogram

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与えられた樹状図オブジェクト、指定された数のクラスターおよび色のベクトルに基づいて、樹枝状虫の枝を着色するためにR functionを書きたいと思います。 dendextendの代わりにbase Rを使用します。同様の質問へhttps://stackoverflow.com/a/18036096/7064628：この回答から正確なコード使用上記のコードで # Generate data set

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端末にシンプルテキストの樹状図を表示する方法は？

私はこのような私の端末に表示するであろう単純なテキスト樹形図といくつかのデータをプロットするために（それらの距離によって国のグループ）をしようとしています： ---- Monaco ----| ---- Croatia ----| ---- Montenegro ----| ---- Serbia

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Rデンドログラムのラベルを取り除くには？

このプロットのすべてのlablesを削除するにはどうしたらいいですか？それとも、もっとうまくいっても、どうやって読みやすくすることができますか？私は、このコマンドで作成した： plot(hclust(distance), main="Dissimilarity = 1 - Correlation", xlab= NA, sub=NA) 私は実際にxlabまたはsubラベルを削除する必要があり

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Rでapeパッケージを使用して樹形図を描くには？

は私が〜200×200サイズの距離行列を持って、私のサイズは、プロットが表示されるように大きいR にAPEライブラリのBioNJオプションを使用して系統樹をプロットすることができませんでし私は、視認性を向上させることができますどのような方法

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円形のデデキストランデンドログラムにラベルを付ける

私は、組成データの円形の樹状図をプロットしようとしています。次のコードを使用してください： library(dendextend) library(circlize) library(compositions) data("Hydrochem") hydro<-Hydrochem d <- dist(hydro[7:19], method="euclidean") hc <- hcl

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ラベルを含む水平樹形図R

私はラベル付きの垂直樹形図をプロットすることができますが、水平であるときにはラベルを追加することはできません。マイデータは次のようになります。を Company Industry1 Industry2 Industry3 Google 3% 5% 6% Apple 2% 6% 1% 私はデータをインポートすると、最初の列が私のラベルが含まれていますが、行はなどわずか1、2、

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デンドログラム内のクラスターラベル

デンドログラムにクラスターのラベルを追加する方法はありますか？簡単な例を参照してください。 hc = hclust(dist(mtcars)) plot(hc, hang = -1) rect.hclust(hc, k = 3, border = "red") 所望の出力は次のようになります。任意の提案のための感謝を！

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SciPyの階層的樹状図を複数の閾値でクラスタに分割する

私はSciPyの樹状図を複数の閾値でいくつかのクラスタにカットしたいと考えています。私はfclusterを使用しようとしましたが、1つのしきい値だけをカットすることができます。（ここで私は、たとえば、別の質問から取ってきたコードの一部である。） import pandas data = pandas.DataFrame({ 'total_runs': {0: 2.489857755536

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ラベルに基づいた再配列と色の樹状図

デンドログラムの順序と色を制御しようとしています。明らかに樹状図のポイントは類似性によって順序付けることですが、ブランチ内では意味をなす順序（アルファベット/数字）を設定したいと思います。 library(vegan) library(stats) x <-data.frame(data = c(1:10)) y = data.frame(type = c("A","B","C","A",