igraph

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RMarkdownページのサイズを大きくする（非再スケーリングされたigraph）

RMarkdownドキュメントに大きなigraphプロットを収める必要がありますが、ノードとラベルが重なり合っています）。は、私は仕事ができる「=再スケールFALSE」引数を使用して考え出したが、その後の問題は、プロットの大きさに関わらずfig.height、fig.widthオプションの、ページサイズよりも大きいということです。あなたが再現可能な例を見ることができます下（.Rmdとニットとして

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頂点属性（名前）とエッジの色/重みに基づいてサブグラフをチェックする

グラフmが他のグラフgのサブグラフである場合、R/igraphをチェックする方法は、属性頂点（名前）エッジ？ funtcion is_subgraphic_isomomorphic_to(m,g, method=vf2)が動作しない、頂点IDを使用する（iは属性（名前/色）を使用する必要がある）ため例： graph m graph g

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インタラクティブなigraphプロットでのタイトルと凡例のプロット？（R）

グラフのタイトルと凡例を追加するのに問題があります。 tkplotまたはplotでは不可能ですか？ dff <- data.frame(a = c(0,1,2,3,4),b = c(3,4,5,6,7)) nod <- data.frame(node = c(0:7),wt = c(1:8)) pg <- graph_from_data_frame(d = dff, verti

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R igraph：条件によるラベル頂点

私は、頂点のセットといくつかの "特別な"頂点の名前を持つリストを持つグラフgを持っています。グラフに、これらの特殊な頂点に対してのみ頂点名のラベルを表示したい。私はこのような何か試してみました： plot(g, vertex.size = 4, vertex.label = ifelse(V(g) %in% usernames, V(g)$label, ""), asp = F) しかし

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マークダウンのループ中にedgebundleがプロットされない

edgebundleRを使用して一連のコードグラフを作成する自動レポートを作成しようとしています。私はループ内でそれを使用しない場合 plot_chords <- function(x,t,pos) { ... stuff I do with the data ... g <- graph.adjacency(mydata, mode="upper", we

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igraphの特定のノード属性名をPythonで変更します

私はnameという属性をグラフgに持っています。属性に関連付けられた特定のノードの名前を別の名前に変更したいと思います。例えば私は(4,10)と呼ばれる知って(3,1)を希望 from igraph import * g = Graph(4) g.vs['name'] = [(10,1), (269,1331), (3,1), (10,10)] print g.vs['name'] [(

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エッジリストに階層型ネットワークのテーブルを変換するためにどのように効率的にR

に私はオープンの多くがそこにいることを知っているとエッジリストの生成についての質問に答えたが、私は私の場合に適合どれも見つからなかった：私はテーブルを持っているをこれは厳密に階層的なネットワークを表し、ソースノード、ターゲットノード、および相互作用のタイプの3つの列を持つものに変換します。ように表は、全ての第1レベルのノードをリストの最初の列とかなり重複している2番目の列は、すべての対応する第二

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2つのリストを比較して "ヒット"をデータフレームに出力する方法

私はこことGoogleで答えを見つけようとしましたが、運が良かったのでこの問題で数日間苦労しました。私は、サイクルが慎重なコミュニティー内にあるのか、それらの間にあるのか、パターンがないのかを調べるためにネットワークを分析しています。私のデータは、サイクルのリスト（ループを形成する3つのノード）とコミュニティのリスト（ノードの可変量）です。私は2つの質問があり、1）どのように二つのリストを比較する

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R：リスト内で選択されたノードに隣接IGRAPHノードを収集

として玩具グラフを定義：無作為として2つのノード > library(igraph) > g = graph(c("John", "Jim", "Jim", "Jill", "Jill", "John", "Jim", "Bob", "Bob", "Alice", "Alice", "Jill"), d