植物の種類がいくつかあり、種類ごとにいくつかのDNA配列データ( ".fastq"ファイル)があり、これらの植物の微分解析を行う予定です。 R.しかし、私はこの分野の新しい人です。それをどうやって行うかについての提案はありますか?fastqファイルのedgeRによる微分解析
-4
A
答えて
2
あなたはedgeRとのドキュメントをお読みください:
- あなたがedgeRとにカウントを与えるカウント行列
- を生成するための参照アノテーションでHTSeq-カウント使用
- STARまたはTopHat2ようなもので読み取っ合わせます、差動テストを行いますどの
EDIT:
http://www.bioconductor.org/packages/release/bioc/vignettes/edgeR/inst/doc/edgeRUsersGuide.pdf
例については、4.2節を参照してください。
+1
@ user440446あなたが役に立つと思うなら、答えを受け入れることを検討してください。クリックすることができるティックが表示されます。 – SmallChess
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