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CUDAでホストとデバイスのための効率的な疎テンソルへのハッシュテーブルのアプローチ

CPUやGPUのいずれかで再帰によって生成された値を格納するために使用される多次元疎テンソルで動作する効率的なコードを実装したい。この目標を達成するためには、aligned storageのデータを持つハッシュテーブルが、ストレージとパフォーマンスの間で良好な妥協点を示していると私は推測しています。 私はCPUの実装の最小限のバージョンを持っていますが、コードは以下のとおりです。 私の目的は、GP

c++11 cuda hashtable gpgpu scientific-computing 2016-07-15

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私のプロジェクト用のLuaユースケース

私はいくつかの基本的な要件があります。 Windows PCの場合 いくつかのファイルを読む。 読み取りファイルに対していくつかの科学計算を実行します。 周辺機器を介してボードにデータを送受信します。 軽量のスクリプト言語を探していて、Luaを見つけました！ルアが良い選択であれば、ここで検証したいですか？質問は次のとおりです。 USB、Ethernet et.alを処理できるLuaライブラリはあり

lua scientific-computing 2016-04-17

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なぜ「ValueError：配列を持つ配列要素を設定していますか？」 Scipy.optimizationからbrute関数を使用する場合？

一連のパラメーターが与えられた場合の電気生理学的データを予測するモデルの作業。このスクリプトは、実験データに最も近い予測を与えるパラメータの値を見つけようとしています。私はPython 2.7、Scipy 0.17.0、Numpy 1.10.4を実行しています。スクリプトは以下に添付されています。エラーが発生している行はepsc_sims[n,1] = r_prob*poolsizeです。ここで

python numpy scipy scientific-computing 2016-08-03

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ncmlから可変長変数を使用してnetCDF-4ファイルを作成する方法は？

私は、可変長変数を持つnetCDF-4ファイルを書き込もうとしています。 理想的にはncgenユーティリティを使用しましたが、ncml入力をサポートしていません。したがって、私はnetCDF-java lib 4.6.6を使用しています。可変長変数なしncml以下が実行可能なのnetCDF-4ファイルを生成します。 java -Xmx1g -classpath ~/dump/netcdfAll-4

java dataset netcdf scientific-computing ncml 2016-06-29

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ベクトルが

動作しない、私はちょうどmayaviのvector_cut_plane機能をテストしてみましたmayaviで飛行機をカット：ベクトル場カットが赤に従わないので、動作するようには思えないしかし import numpy as np from mayavi import mlab x, y, z = np.mgrid[0:1:20j, 0:1:20j, 0:1:20j] u = np.sin

python scientific-computing mayavi 2016-06-30

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2セットのノイズの多いデータの交差を見つけるにはどうすればよいですか？

私は現在グラフから冗長なデータポイントを削除するはずのスクリプトを書いています。私のデータには隣接するデータセットからの重複が含まれています。 （xオフセットがわずかに重なる2つのガウス分布を想像してみてください）重複領域の高い方の値だけに興味があり、単一のスペクトルを作るためにデータを結合すると最終的なグラフがすべてノイズにならない。ここでは） 私の問題です： 1）xの値は、2つのデータセット間

algorithm dataset scientific-computing idl-programming-language data-science 2016-03-31

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pubchemからモノアイソトピック質量に一致するsdfファイルを抽出

私は、特定の正確な質量とその正確な質量の10ppmの範囲で一致する化合物のsdf形式で化学構造を抽出しようとしています（exactmass-cmpndmass/exactmass）* 10^6。これを実現する方法は、pubchemに接続するpythonまたはjavaプログラミング言語を使用します。

java python scientific-computing pubchem cheminformatics 2016-05-22

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ログ空間で作業してアンダーフローを避けるには、どのように合計を評価しますか？

私は線形補間で計算します。計算する場所は： p' = \lambda_1*p_1 + \lambda_2*p_2 + \lambda_3*p_3です。 ただし、p_1、p_2、p_3は連結確率であるため、アンダーフローによって浮動小数点として表現することはできません。だから私はlog2(p_1)、log2(p_2)、そしてlog2(p_3)というログ空間で働いています。 確率を記録すると、p'また

logarithm scientific-computing underflow 2016-04-05

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は、どのように私は私が解決するために、以下の機能を必要としているcurve_fit

を使用して、以下の機能を合わせて x_data = [4, 6, 8, 10] y_data = [0.86, 0.73, 0.53, 0.3] popt, pcov = curve_fit(function, x_data, y_data,(28.14,-0.25)) answer = function_solve(0.5, popt[0], popt[1]) コードを実行しようと

python numpy scipy curve-fitting scientific-computing 2016-04-13

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