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Molecular Dynamics Simulatorに最適な言語をプロダクションで実行します。 （Python + Numpy？）

頑丈な分子動力学シミュレータを構築する必要があります。私はpython + numpyが良い選択であるかどうか疑問に思います。これはプロダクションで使用されるので、私は良い言葉で始めたいと思っていました。 eg.scalaのような関数型言語から始めるべきかどうか疑問に思っています。スカラ計算における科学計算のための十分なライブラリサポートがありますか？またはあなたが良いと思う他の言語/パラダイムの

python scala numpy simulation scientific-computing 2011-08-04

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大きなNumPy配列をファイルに書き込む効率的な方法

現在、私はPiCloud上でODEソルバーの複数の繰り返しを含むプロジェクトを実行しています。各反復では、約30行と1500列のNumPy配列が生成され、各反復は前の結果の配列の末尾に追加されます。 通常、これらのかなり大きな配列を関数が返すようにして、それらをメモリに保持し、それらをすべて1つに処理させます。 を除くPiCloudは、送信コストを抑えるために、機能によって返されたり返されるデータ

python numpy scientific-computing 2012-01-08

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科学シミュレーションではどのようにGPUが使用されていますか？

GPUsはどのようにして科学的シミュレーションに使用されますか（天体物理学/宇宙論の場合は特に？）

gpgpu scientific-computing 2011-08-14

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"インクリメンタルコンピューティング"（多分C/C++）をサポートするプログラミングツールチェーン

大きなデータセットの結果を準備するアルゴリズムを記述したいと思います。各データセットが変更されると、影響を受けるすべての出力を段階的に更新します。 Incremental computingと呼ばれています。 このアプローチをサポートするプログラミングツール、ライブラリ、コンパイラ、プログラム解析などはありますか？ P.S.私はIncremental computingがアルゴリズムの適切な構築で

code-analysis scientific-computing dataflow grid-computing 2012-01-20

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科学シミュレーションデータ、Mongodb + HDF5のデータ持続性？

私は、複数の物理学とシミュレータを含むモンテカルロシミュレーションソフトウェアパッケージを開発しています。私はオンライン分析を行い、派生データの生データへの依存性を追跡し、 "温度> 400の位置と（x0、y0）の近くの位置に波形を与える"のようなクエリを実行する必要があります。したがって、メモリ内のデータモデルはかなり複雑です。 アプリケーションはPythonで書かれ、各シミュレーション結果はP

python mongodb orm scientific-computing hdf5 2012-01-25

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私のシミュレーションに十分なアルゴリズムを見つけるためにいくつかアドバイスが必要です

私はいくつかの粒子の粒子のMonte-Carlo simulationをやっています。私のコードにいくつかのボトルネックがありますが、主なものは私が試行したいくつかの中で、私はすべてのパーティクルプロパティを更新する必要があるということです。コードはC++で書かれており、現在はいくつかのループがあります。 1.すべてのパーティクルの古いプロパティを保存して新しいプロパティを更新するループ。 2.相

c++ algorithm scientific-computing 2011-10-20

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PythonコーディングDojosの科学的問題

ブラジルのPythonコミュニティで科学的アプリケーションのコーディングDojoを構成しています。主な目標は次のとおりです。Numpy（および他の科学的なライブラリ）のスキルを向上させる。この種のアプリケーションでTDDの使用を改善する。これらのAPIの制限をよりよく理解することができます。 私はこれらの目標に合った問題を探しています（主にNumpyを使用しています）。助言がありますか？ アップデ

python numpy tdd scientific-computing 2011-07-15

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Rubyのスパース行列ライブラリ

Rubyから使用できるSparse Matrixライブラリを探しています。私は現在、 "gsl"宝石によって提供されているGNU Scientific Library bindingsを使用していますが、専用の希薄なマトリックスライブラリを使用した場合、私のアプリケーションはより最適化されます。私はlinalgとNArrayのライブラリを調査しました。これらの3つのライブラリのどれも、疎行列最適化

ruby math linear-algebra scientific-computing sparse-matrix 2011-07-18

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3次元バイナリ配列を再帰的に分割して、1に等しいすべてのエントリのビットストリームを作成する

動的に割り当てられたバイナリ（要素のみが0と1）を別々の3D配列に分割しようとしています。次の図は、それが少し明確に理解することができます： http://img521.imageshack.us/img521/4296/splittingsteps.png それは10.000要素のまばらな3D配列です。私の配列の要素である1ごとに、固有のビットストリームを作成したいと思います。得られたサブドメイ

c scientific-computing 2011-12-15

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C用の3Dビジュアライゼーションライブラリまたはツールキットはありますか？ （No C++ please！）

基本的に私は科学的用途のためのC用のOpenGL 3Dビジュアライゼーションツールキットが存在するかどうかを知ることに興味がありますか？

c opengl scientific-computing 2011-09-07

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