隠しマルコフモデルのRまたはPythonでの実装

Question

PythonのR（Bioconductor）でHMMを実装する方法に関する良い文献やチュートリアルを知っていますか？ （特に配列解析用）

Answer 1

CRANにはHMMパッケージがありますが、これは始めるのに適しています。

http://cran.at.r-project.org/web/packages/HMM/index.html

これは、簡単にR自体から発見された：Python用

RSiteSearch("HMM") 

Answer 2

GHMMはtutorialを持っていますが、それは短いですし、彼らは

"Currently, the GHMM is utterly lacking in documentation.は" 私はthe Rabiner paperが好きなことを認めます。

私はthe use of HMM for genetic mappingに関する技術レポートを持っています。

Rabinerを少し読んで、何かを実装することをお勧めします。前方/後方方程式はほんの数行である。