bioconductor

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Go annotationが証拠コードによって表される特定の用語にどのように対応しているかについてある程度の信念を割り当てたいと思います。 evidence codesの異なるタイプがあります。実験的証拠コード（IDA、IEP、IGI、IMI、IPI）著者ステートメント証拠コード（NAS、TAS）学芸ステートメントコード（IC、NDは、）コンピュータ解析の証拠コード（ISS、RCA）ど

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エラー： 'AnnotationDbi'に必要なパッケージ 'DBI'がRで見つかりませんでした。（v 2.7.0）

古いバージョンのR（Windows版2.7.0）をインストールしました。私はGO.dbをロードするとRでbioconductorを使用するためのは、source("http://bioconductor.org/getBioC.R") biocLite("GO.db") library("GO.db") を使用し、それがエラーを与える： Loading required package:

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ggtreeのgetSubtree関数です。そのような関数はありません。

ggtreeパッケージv1.8.2をインストールしました。getSubtree関数を使いたいと思っています。 getSubtreeでエラー（）：しかし、私は驚くべきエラー:)取得私はggtreeパッケージのメンバーとしてRstudioヘルプでのfuctionを見ていても機能「getSubtree」を見つけることができなかったとし、 https://bioconductor.org/packag

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GenomicFeaturesパッケージのインストールの問題

簡単なインストールの質問ですみませんが、申し訳ありませんが、自分で解決できないことは自分の生産性を著しく損なうものです。とにかく、私はBCウェブサイトが示唆するようにGenomicFeaturesをインストールしようとしました。 > source("http://bioconductor.org/biocLite.R") > biocLite("GenomicFeatures") 私は次のエ

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ダウングレードRのバージョンとRのパッケージBioconductor

こんにちは皆、私は現在Bioconductor v2.13のdebianサーバーでR 3.0.2を実行しています。私の質問は簡単ですが、インターネットで検索しても明確な答えは得られませんでした。どのようにすればR 3.0.2からダウングレードできますか？ R 2-15に？私はR 3.0.2を維持しているので、Bioconductorをv2.12にダウングレードするにはどうすればよいですか？は

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deseq2の実験結果が

RでDESeq2パッケージを使用しようとしていますが、入力データから必要なRangedSummarizedExperimentオブジェクトを作成できません。私はこれを行うためにいくつかのチュートリアルとビネットを見つけましたが、それらはすべて私とは異なる生データセットに適用されるようです。私のデータは、列名として行名と患者IDのような遺伝子名を持ち、データは単に整数のカウントデータです。このタイプ

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Rでエラーメッセージを表示する方法

私は生物工学に関するいくつかのチュートリアルを試しています。しかし、私はエラーメッセージを、私は検索したい/提出したいです。残念ながら、Rはフランス語で設定されたシステムにインストールされているので、Rはフランス語でメッセージを返します。どのように私は英語でこれらのメッセージを持つことができます。私のシステム： Ubuntu 10.04 runing gnome 3; Rのバージョン（2.15.

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DLLの最大数に達しました

新しいライブラリを読み込もうとすると、このエラーが発生します。 Installation failed: unable to load shared object 'C:/R/R-3.4.0/library/curl/libs/x64/curl.dll': `maximal number of DLLs reached... curlとは関係ありません。どのライブラリでもかまいません

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オンザフライでデータパッケージを取得するために 'require'パッケージコードを使用するR

私は、様々な生物工学注釈データパッケージを使用するRパッケージを作成しています。特定のデータパッケージはユースケースによって異なります。そのため、私はこのような何かを行う機能を持っている： if (!require(biocpack_name, character.only=T)) { source("https://bioconductor.org/biocLite.R")

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BioconductorとCRAN

今日、私はCPAN以外のリポジトリがあることを発見しました。このリポジトリはBioconductorです。これまでのところ、Bioconductorのinstallationプロセスは、従来のCRANのinstall.packages()と比べてわずかに異なることに気付きました。私がBioconductorからいくつかのパッケージを使いたいと思ってもらえませんか？いくつかの依存関係の問題（例えば、