フォルダに含まれるすべてのfastqファイルをfasta形式に変換したいが、各ファイルは元の名前を保持するが、fasta拡張子では次のコードをperlで作成し、しかし、それは各ファイルの最後のシーケンスを抽出するだけです!!! #!/usr/bin/perl
use strict;
use warnings;
use Getopt::Long;
my ($dir, $files, $f
私はpythonスクリプトを書いており、可能であればFASTA形式のファイルではなく、文字列変数としてblastnに問い合わせのシーケンス情報を渡したいと思っています。 BiopythonのSeqIOを使用して、いくつかの転写物名をキーとして、そのシーケンスを関連値として保存しました。 だから、だから、辞書は今、私はブラストクエリおよび対象に、辞書内の配列情報に解析するこの {'var_F': S
私はいくつかのDNA配列を持つfastaフォーマットのファイルを持っています。私は、同じシーケンスIDを維持しながら、別の小さいシーケンスの各シーケンスの内容を変更したい。 新しいシーケンスがリストにあります。 with open("outfile.fa", "w") as f:
for seq_record in SeqIO.parse("ma-all-mito.fa", "fasta
これはdna配列をタンパク質配列に翻訳するために書いたコードです。関数は機能しますが、タンパク質配列を出力しようとすると、最後の配列だけがファイルに表示されます。 def translate(dna_seq): #create function
"this function translates a dna sequence into a single letter code amino