分散分析Pythonで

Question

私はこの

  Ens_prot_ID  Ens_gene_ID Sample  TPM  ppm ppm/TPM 
0  ENSP00000416240 ENSG00000109072 liver 2540.4 0.003 0.000001 
21597 ENSP00000226218 ENSG00000109072 liver 2540.4 110.000 0.043300 
... 

以下のコードが動作していない

のように見え、「KeyError例外：0」を与えるDF持っ

from scipy import stats 
proteins=df['Ens_prot_ID'].unique() 
stats.f_oneway([df[df['Ens_prot_ID'] == prot]['ppm/TPM'] for prot in proteins]) 

を

は、私はそれがだ

from scipy import stats 
proteins=df['Ens_prot_ID'].unique() 
for prot in proteins: 
    df[df['Ens_prot_ID'] == prot]['ppm/TPM'] 

を実行しているすべての問題を持っていない問題がf_oneway（）入力の私のフォームを好きではないように思えます。手で入力されていないグループ名を受け入れる関数を得る方法はありますか？

Answer 1

あなたはこのようにそれを行うことができます。

stats.f_oneway(*(df[df['Ens_prot_ID'] == prot]['ppm/TPM'] for prot in proteins)) 

*は、あなたが関数に複数の引数を渡すことができます：https://pythontips.com/2013/08/04/args-and-kwargs-in-python-explained/

私はまた、あなたのDataFrameが非常にある場合にはgenerator comprehensionにリストの内包を変更大。