pbs

    0熱

    1答えて

    QSUB無視メモリ制限

    私のコマンドは次のとおりです。 qsub -t 1:30:1 -q test.q -l r_core=5 -l r_mem=30 run.sh これは、1台のサーバ上の各、30インスタンスを起動しますが、彼らはRAMの指定された30ギガバイト以上を消費する傾向があります。 この理由は何ですか？
    memory pbs qsub 2016-07-20

    0熱

    1答えて

    トルク/ PBSがmunge.socket.2を見つけることができません

    私はMPIクラスの仮想クラスターを作成しようとしています。私は自宅で仕事をすることができ、大学のラボでは一日中はできません。私はmungeでこの問題を解決する方法を今2日間把握することはできません。 私が持っている問題の出力は私のhostsファイルは、私は私ができる限り読みしようとしたと私は、これらのガイドになってしまったこの 127.0.0.1 localhost localhost.local
    cluster-computing virtual fedora pbs torque 2016-09-16

    2熱

    1答えて

    すでに完了しているジョブを待つ

    他の作業が完了したら、pbsスクリプトを起動します。そのために、私はこのコマンドを使用します： $ job1=$(qsub job1.pbs) $ jobN=$(qsub jobN.pbs) $ qsub -W depend=afterok:$job1:$jobN join.pbs これはほとんどの場合、機能します。しかし、job1とjobNがすでに終了しているときに結合スクリプトを実行す
    cluster-computing hpc pbs qsub torque 2016-07-28

    0熱

    1答えて

    PBSスクリプトの連鎖方法は？

    パート1を終了した後にパート2を実行したいところで、このビットのPBSコードを実行しようとしていますが、何らかの理由でパート1を終了してもパート2が実行されません。どのようにしてこれをパート2を一度に実行させることができますか？任意のプログラムと同様に #!/bin/bash -l #PBS -N AOGC_Contest #PBS -l walltime=10:00:00 #PBS -l
    bash sh bioinformatics hpc pbs 2016-07-29

    0熱

    1答えて

    PBS：ジョブの実行履歴を印刷する方法と、スクリプト名をPBS_JOBNAMEとして使用する方法は？

    qsubとHPCの新機能です。私は3つの小さな質問を得ました： どのジョブスクリプトがどのstderrとstdoutに対応しているかを知る良い方法があります。私は手動でジョブ名とstderrとstdoutを入力することができます（今は$ PBS_JOBNAME。$ PBS_JOBIDをstderrとstdoutに使用しています）。しかし今から6ヶ月後、私は苦労するでしょうそこからジョブスクリプトs
    pbs qsub torque 2016-08-03

    1熱

    2答えて

    PBS：大容量のシリアルジョブで複数のノードのメモリを使用できますか？

    私は高性能コンピューティングの新しいユーザーです。私は合計で約80GBのメモリを必要とするシリアルジョブを実行しようとしています。しかし、1つのノードで使用できるメモリの総量は、私たちのクラスタではわずか12GBです（研究所のクラスタは少し古いです）。私はいくつかのガイドをオンラインで読んだのですが、私の理解によれば、MPIジョブだけが複数のノードからメモリを利用できますか？本当ですか？私の特定の
    hpc pbs 2016-08-07

    1熱

    1答えて

    qsubのJavaプログラムの出力をリダイレクト

    現在、qsubを使用して複数のJava実行可能プログラムを実行しています。 は、私は2つのスクリプトを書いた：1）qsub.sh、2）でrun.shを考える qsub.sh #! /bin/bash echo cd `pwd` \; "[email protected]" | qsub run.sh #! /bin/bash for param in 1 2 3 do ./qsub.s
    pbs qsub sungridengine queueing 2016-08-08

    2熱

    3答えて

    TORQUE：すべてのユーザーに対してjobs配列の送信を禁止する方法：qsub -t？

    私のトルクサーバーマネージャーでは、すべてのユーザーのジョブアレイ送信の使用を禁止したいと考えています：qsub -t。 私は公式の文書で、これを管理できる人はmax_job_array_sizeとmax_slot_limitです。 これらのパラメータを0に設定するかどうかを知りたいのですが：qmgr -c 'set server max_job_array_size=0'とqmgr -c 'se
    cluster-computing pbs qsub torque 2016-07-04

    0熱

    2答えて

    qsub配列のジョブ遅延

    #!/bin/bash #PBS -S /bin/bash #PBS -N garunsmodel #PBS -l mem=2g #PBS -l walltime=1:00:00 #PBS -t 1-2 #PBS -e error/error.txt #PBS -o error/output.txt #PBS -A improveherds_my #PBS -m ae set
    linux bash hpc pbs qsub 2016-07-05

    0熱

    1答えて

    PBSシステムに適切な方法でジョブのリストを提出するにはどうすればいいですか？

    私はPBSシステムに同時に10のジョブしか提出できません。 私は独立した99のスクリプトを持っている場合、私はワンクリックでこれらの99のスクリプトをすべて終了するスクリプトを持っていたいと思います。 jobs1.sh jobs2.sh jobs3.sh . . jobs99.sh これは、以前の10のジョブを終了した後に別の10個のジョブをサブミットすることを目的としています。 現
    linux bash shell pbs 2016-08-30
最新の質問