sungridengine

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    Sun Grid Engineを使用して、サブミットスクリプトqsub内のマスターノードでコマンドを実行する方法はありますか? qsubスクリプト内から/bin/hostnameを実行した場合、私はすでにマスターノードではなくキューコンピュータの1台にいます。要するに、私はちょうど私がちょうど自動的に提出した仕事にqstatを実行したいです。 qstatをワーカーノードの1つとして実行しようとする

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    私は17個のファイルを持っており、これら17個のファイルに対してタスクアレイジョブを実行しています。しかし、今私はこれらの17個の入力ファイルのそれぞれで10回コマンドを実行する必要があります。入力ファイルは input${SGE_TASK_ID} すべてのケースで同じになります。しかし、私は、出力ファイルはビットこの output${SGE_TASK_ID}_order${1/2/3/5..

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    Torqueに慣れていたので、Sun SGEの専門家が助けてくれることを願っています。私の仕事がなぜ終わるのか、私は3時間ほど伝えることができないのか分かりません。ジョブは、ROCKS 6.2の新規インストール時に競合なしで空のキューに提出されています。 3時間未満のジョブは問題ありません。 はここでサーバーの設定(と思う) [[email protected]]$ qconf -ssconf

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    Sun Grid Engineを使用するクラスタでMatlabを使用してイメージ処理を行っています。私の個人的なラップトップでコードは正常に動作しますが、クラスタ上で実行すると、見つからないファイルのいくつかのエラーが発生します。たとえば、存在する.nii(nifti)ファイル(シェルで対話的にmatlabを実行すると読み込める)が見つかりません。出力ログからの抜粋: {^HError using

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    多くの独立したジョブのために、単一のマシン上で実行するPythonコードをmultiprocessing.Poolとしています。グリッドの各ノードがこれらの独立したジョブのために複数のスレッドを実行するなど、SGEグリッド上でさらに並列化することが可能かどうかは疑問です。 もともと、私が持っている: # function def # some_function(param1, param2, p

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    ソースコード用に4ノードクラスタにSGEを構築しました。 Centos7のオペレーティングシステム。そして、私はクラスタで単純なタスクを提出すると、1つのノードで1つのタスクしか実行されていないことがわかりました。どうしたの?ここに私のタスクコードは次のとおりです。 sleep 60 echo "done" 、これはタスクを提出する私のCMDです:qstatの-fを実行すると DIR=`pw

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    私はSun Grid Engineを使って分析を行っています。 しかし、私のコードでは、私はこのエラーが発生することが原因パンダ、インポート: import pandas as pd を:Xサーバに接続できません:3026.0 Iから集まってきた何グーグルと私のsys管理者との会話は、pandasがグラフィックスを読み込もうとしており、SGEはこれを許可していないということです。 私はpand

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    は、送信されたジョブの出力をチェックする方法です。出力ファイルはかなり遅れて書かれているので、何か間違っているかどうかを知りたいのです。 私はPBSのために見ましたが、qsubの出力を直接ホームディレクトリのファイルに書き込むことはできませんが、私の場合は同様の解決策が見つかりませんでした。私は、これはサーバーの設定をせずになんとかではありませんように、それは思われるトルクに見つける何に基づいて

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    Sun Grid Engineキューイングシステムを使用しています。 は、私がどのように見えるのスクリプトを使用して複数のジョブを提出したと仮定します #! /bin/bash for i in 1 2 3 4 5 do sh qsub.sh python run.py ${i} done qsub.shは、次のようになります。5つのジョブが実行されていると仮定すると #! /