hpc

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    私はCOMPSs Sample Application Manualに表示されているインクリメントアプリケーションをCOMPSsで実行しています。 (.COMPSsフォルダ内のSTD出力/エラーとruntime.logに示すエラーが持っていないしていないアプリケーションを実行 $ runcompss -m --debug increment.Increment 5 1 2 3 を、適切に終了:

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    1答えて

    私はCOMPSを学習しています。今までは、すべてがうまくいっていましたが、私はマニュアルに記載されている例だけを実行しました。 私は自分のテストアプリケーションを実行したいので、動作させることができません。私は何かが欠けているに違いないが、私が間違っていることを見ることができない。 私のアプリケーションはAppと呼ばれ、メインクラスのAppと、別のクラスのAppItfというインタフェースを持ってい

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    2答えて

    下の関数が完全にのwhileループをアンロールする、つまりこのループをはがすには、GCC(バージョン4.8.4を使用したバージョン)に指示する方法はありますか?ループの反復回数は、コンパイル時にわかります。58. まず、何を試してみましょう。 GASのouputををチェックすることによって : gcc -fpic -O2 -S GEPDOT.c 12レジスタXMM0 - XMM11が使用されま

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    ARPACKからFortran関数dsaupdを呼び出そうとしています。私は、コードがコンパイルされ、最初の「ここ」プリントアウトにします int ido = 0; int ncv = 2*numeigs; int maxiter = 30; double tol = 1e-13; double * v = (double *) malloc(numcols * ncv *sizeof(d

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    1答えて

    pyCOMPSで実装されたアプリケーションを実行中にエラーが発生しました。アプリケーションはうまくいっていましたが、アプリケーションのいくつかの変更を行い、動作を停止しました。 --- START OF NESTED EXCEPTION STACK TRACE --- *** stack trace of GATInvocationException --- START OF NEST

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    3答えて

    HPCクラスタで対話モードでジョブを実行すると、そのパッケージを読み込むことができます。読み込みに失敗した場合は、 library (failed package)を複数回実行するとロードできますが、qsub my_rscript_job.pbsを実行するとパッケージが読み込まれません。 私my_rscript_job.pbsスクリプトは次のとおりです。 #!/bin/bash #PBS -l

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    1答えて

    実行するジョブが多数あります。各ジョブは、バッファ書き込み、カーネル実行、およびバッファ読み出しから構成され、これらの操作はもちろん順番に実行されなければなりません。しかし、様々なジョブは一意ではないため、同時に実行することができます。 複数のインオーダーコマンドキュー(CUDAストリームと同様)を使用する場合と、1つのアウトオブオーダーを使用する場合(同等の同期化を使用する場合)のパフォーマンス

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    3答えて

    78TB HDF5データセットを2dブロックパーティション方式で作成しようとしています。これは、書込み中のブロックが書かれていない行にまたがるときに非常に遅くなります。なぜなら、HDF5はディスクスペースを割り当てて、欠落しているエントリをゼロで埋めるためです。 代わりに、作成したデータセットのディスクスペースをh5pyに割り当てて、それを決して埋めることはできません。これは表16のthe HDF

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    1答えて

    私は確率的要素を持つ研究関連シミュレーションを実行しようとする物理学者です。シミュレーションはいくつかの非相互作用部分に分割することができ、各部分はランダムに進化するため、実行間の相互作用は必要ありません。 私は、後ですべてのジョブから返された結果を分析するために、別のコード/ファイルを使用します(これは問題に関連しておらず、何が起こっているのかを明らかにするためにのみ提供されます)。 研究所のH

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    私は、強制的に指示されたグラフレイアウトを計算するアルゴリズムを実装しています。いくつかのループを加速するためにOpenMPディレクティブを追加したいと思います。いくつかのコースを読んだ後、私は私の理解に基づいていくつかのOpenMP指令を追加しました。コードはコンパイルされますが、シーケンシャルバージョンと同じ結果は返されません。 私のコードを見て、私のOpenMPバージョンで何がうまくいかない