h5py

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への追加Iは、以下の構造を持つファイルを有する：時間1つのインデックス1つの値X 値Y 時間1 インデックス2 を値x 値y 時間2 インデックス1 ... 私はh5pyを使用してHDF5形式にファイルを変換し、別のグループに分け、それぞれのインデックスから値をソートしたいです。（私は...一度だけ、各グループに書き込むことができています）私のアプローチは f = h5py.File(f

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"Python.h 'ファイルが見つからないため、H5pyのカスタムHombrew式内でpipを使用してインストールできません。

開発中のPythonアプリケーションのHomebrew式をbrew install --debug tclose/pype9/pype9でインストールしようとしています。しかし、リソースからh5pyをインストールしようとすると、clangエラーが発生します。次のようにHombrewのエラーメッセージは次のとおりです。 ==> /usr/local/Cellar/pype9/0.2/libexec

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h5py create_datasetループが遅い

私は各データセットが90x18のnumpyの配列であるhdf5ファイルを作成しようとしています。最終的なサイズがおよそ40GBのファイルに対して、2704332の合計データセットを作成する予定です。 with h5py.File('allDaysData.h5', 'w') as hf: for x in list: start = datetime.datetime.now

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Rのエラー：モデルの保存とロードにh5py Pythonパッケージが必要です

私はR 3.4.2を使用しています。私は、コードの最後の行は、私は端末からh5pyパッケージを再インストールしようとしたエラー Error in keras::load_model_hdf5(file_path) : The h5py Python package is required to save and load models を生成decryptrpackage libra

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hdf5テーブルにnull値を格納する方法は？

null値をhdf5ファイルに保存したい。 h5file = tables.open_file("demo.h5", mode="w", title="demo") group = h5file.create_group('/', 'depth','Dept Data information') table = h5file.create_table(group, 'readout', dep

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hppyデータセットのインデックスとしてnp配列を使用することは可能ですか？

別々のファイルに含まれるいくつかのデータセットを最終ファイルに属する別のデータセットにマージする必要があります。部分データセット内のデータの順序は、最終データセットにコピーされるときには保持されません。部分データセット内のデータは、インデックスを介して最後のデータセットに「マップ」されます。私は2つのリスト、final_indicesとpartial_indicesを作成し、書いた： final

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hdf5ファイルのシャッフルDask配列チャンク

非常に大きな配列がhdf5ファイルに格納されています。私はそれをロードし、Dask配列として管理しようとしています。私の挑戦は、私がプロセス内でこの配列の時間をシャッフルする必要があるということです。これはメモリよりも大きな配列をシャッフルするのは難しいことです。だから私は成功なしでしようとしているのは、dask配列チャンクをシャッフルすることです。 #Prepare data f=h5py

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Python - 時系列をデータセットに保存する方法

MIDIソングをノートとコードの組に変換するパーサを構築します。各曲について、タプルのリストを返します。最初の項目は音符で、2番目の項目は音符のセットです。その結果得られるデータは、形状が[(note, {chords})]である。 [(20, {21, 23}), (30, {22, 24, 26, 28})]。コードが任意の長さになる可能性があることに注意してください。私は、多くの曲からデー

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データが完全に読み取るには大きすぎる場合、HDF5形式ファイルのデータを部分的に読み取る方法

私は科学的研究目的でHDF5形式のデータを分析しています。私はPythonのh5pyライブラリを使用しています。ここでは、読みたいHDFファイルが非常に大きいです。そのファイルサイズは約20GBで、そのデータの主要部分は400000 * 10000浮動小数点数です。私は一度データを読み込もうとしましたが、私の開発環境Spyderはメモリ不足のために強制終了しました。それから部分的にそれを読んでこ

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Pandas DataframeをHDF5データセットに書き込む方法

私は、各グループ内に複数のグループとデータセットを持つ、入れ子になったhdf5ファイルにPandasデータフレームからデータを書き込もうとしています。私はそれを日常的に将来的に成長する単一のファイルとして保持したいと思います。私は、入れ子構造が作成された import h5py import numpy as np import pandas as pd file = h5py.File(