両方のpythonのscipy.stats.ranksumsとRのwilcox.testは、Wilcoxonランクサムテストのための両面p値を計算することになっています。私は、同一のデータの両方の機能を実行したときしかし、私は桁違いに異なるp値を取得する:pythonのscipy.stats.ranksumsとRのwilcox.test
R:
> x=c(57.07168,46.95301,31.86423,38.27486,77.89309,76.78879,33.29809,58.61569,18.26473,62.92256,50.46951,19.14473,22.58552,24.14309)
> y=c(8.319966,2.569211,1.306941,8.450002,1.624244,1.887139,1.376355,2.521150,5.940253,1.458392,3.257468,1.574528,2.338976)
> print(wilcox.test(x, y))
Wilcoxon rank sum test
data: x and y
W = 182, p-value = 9.971e-08
alternative hypothesis: true location shift is not equal to 0
のPython:
>>> x=[57.07168,46.95301,31.86423,38.27486,77.89309,76.78879,33.29809,58.61569,18.26473,62.92256,50.46951,19.14473,22.58552,24.14309]
>>> y=[8.319966,2.569211,1.306941,8.450002,1.624244,1.887139,1.376355,2.521150,5.940253,1.458392,3.257468,1.574528,2.338976]
>>> scipy.stats.ranksums(x, y)
(4.415880433163923, 1.0059968254463979e-05)
だから、Rは私に1Eを与えます-7の間にPythonが私に1e-5を与える。
この違いはどこから来て、どれが「正しい」p値ですか。
はい、Scipyはここでzスコアを返します。 http://docs.scipy.org/doc/scipy/reference/generated/scipy.stats.ranksums.html –
私は、綴りを具体的に扱わなければならない可能性がある、繋ぎ合わせをするときに違いがあると思います。 – seberg
説明ありがとうございます! Scipyに厳密なp値を計算させ、結びつきを処理させる方法があるかどうか知っていますか?私はScipyにscipy.stats.mannwhitneyuという別の機能があることを知っています。これは結びつきを処理して連続性の修正を行いますが、これはまだ正確ではなく、ドキュメントには少なくとも20個のサンプルが必要です。 – Nils