R次のように私はsimlarityマトリックスを有するsimlarityマトリックスと

Question

をクラスタ化ヒートマップを表示する：

xx <- cor(matrix(rnorm(650), ncol =25)) 

Iがヒートマップで、この類似度行列及び画像をクラスタ化します。次は正しいですか？

yy <- heatmap(1-xx, Rowv=T, scale='none',symm = T,keep.dendro=F, 

ここでは、非類似行列である1-xxをとっています。これは正しいことなのでしょうか、それとも他の方法で入力すべきでしょうか？

Answer 1

Rの例題の1つを読んだときにわかりました。ここで、類似性マトリックスを使って何をしなければなりません。

hU <- heatmap(xx, Rowv = FALSE, symm = TRUE, 
       distfun = function(c) as.dist(1 - c), 
       hclustfun = function(d) hclust(d, method = "single"), 
       keep.dendro = FALSE) 

私はこれが誰かを助けることを願っています！