はGNU Rのすべてのパッケージ

Question

を再インストール時には、あなたはハドレーウィッカムrecommends GNU Rで問題を思い付く：

を私は再インストールするすべてのパッケージをお勧めします。

問題はできるだけ最良の方法でこれを行う方法です。私はinstall.packagesがoverwrite existing versionsになることを知っています。

のみCRANパッケージ（GitHubのか、他のソースから何も特別な）を使用する場合は、この単純なアプローチは、私の仕事：

my.packages <- rownames(installed.packages()); install.packages(my.packages);

しかし、私は何を私がinstalled dev versions from GitHubを持っている場合たとえば、行う、または使用することができます公開されていないローカルパッケージもありますか？

私は何を探していますが、パッケージに変更する方法

にチェックを新規インストール（アップグレード/ダウングレード）からもたらされる

1. 同じソース

2. からもう一度パッケージをインストールします。

   私の古いパッケージフォルダをバックアップする

これらの要件に対処できるスクリプトはありますか？

Answer 1

（（1）のための部分的な解決策 - ダウングレード/アップグレードされるパッケージを見つける）これが唯一のおおよそのものです

my.packages <- installed.packages(); 
my.avail <- available.packages(); 

z <- merge(
     my.packages[,c("Package","Version")], 
     my.avail[,c("Package","Version")], 
     by = "Package", suffixes = c('.my','.avail')); 

z$Version.my <- as.character(z$Version.my) 
z$Version.avail <- as.character(z$Version.avail) 

# my packages which will be upgraded 
subset(z, Version.my < Version.avail) 

# my packages that will be downgraded 
subset(z, Version.my > Version.avail) 

は、私が考える - 依存関係に応じて、あなたはすべてのアップグレードを取得することはできません。しかし、devバージョンを使用している場合、ダウングレードが期待されるはずですか？