Rパッケージのコンパイルエラー

hsphaseパッケージ（CRANで利用可能なRパッケージ）をコンパイルしたいと思います。Rパッケージのコンパイルエラー

私はこのコマンドをR install.packages("hsphase")で使用しました。

私は次のエラーを持っている： gccのバージョン6.1.1 20160621（Red Hatの6.1.1-3）（GCC：

g++ -m64 -shared -L/usr/lib64/R/lib -Wl,-z,relro -specs=/usr/lib/rpm/redhat/redhat-hardened-ld -o hsphase.so FastDist.o MAF.o Ohd.o TypeConversion.o block.o block4Phase.o co.o diag.o hsp.o main.o memory.o oh.o swDetect.o [1] 0 -L/usr/lib64/R/lib -lRlapack -L/usr/lib64/R/lib -lRblas -lgfortran -lm -lquadmath -fopenmp -L/usr/lib64/R/lib -lR 
g++: error: [1]: No such file or directory 
g++: error: 0: No such file or directory 
/usr/share/R/make/shlib.mk:6: recipe for target 'hsphase.so' failed 
make: *** [hsphase.so] Error 1 
ERROR: compilation failed for package ‘hsphase’ 
* removing ‘/home/mhf/R/x86_64-redhat-linux-gnu-library/3.3/hsphase’ 

The downloaded source packages are in 
    ‘/tmp/RtmpYukJQa/downloaded_packages’ 
Warning message: 
In install.packages("hsphase") : 
    installation of package ‘hsphase’ had non-zero exit status

私は、Fedora 24.

グラム++バージョンを使用しています）

リンクフラグを確認してください：これは何ですか： [1] 0

出典

2016-07-11 user1436187

g ++があります。リンクエラーが発生しました。 – user1436187

私は別のRパッケージをインストールするのと同様の問題を抱えていましたが、後で必要なパッケージの依存関係の一部が見つからないことが判明しました。 'install.packages（" hsphase "、dependencies = TRUE）' –

あなたは、レベル依存。このような '--specs =/usr/lib/rpm/redhat/redhat-hardened-ld'のような行は良いヒントです。 [この質問]（http://stackoverflow.com/questions/34624428/g-error-usr-lib-rpm-redhat-redhat-hardened-cc1-no-that-file-and-directory）を参照してください。 – nrussell

私はこれをコメントscr/Makevarsファイルの行：

#PKG_LIBS = `$(R_HOME)/bin/Rscript -e "Rcpp:::LdFlags()"` $(LAPACK_LIBS) $(BLAS_LIBS) $(FLIBS) $(SHLIB_OPENMP_CXXFLAGS)

ここでパッケージをコンパイルできます。

出典

2016-07-23 04:33:39 user1436187

Rパッケージのコンパイルエラー

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