多くの配列の計算（平均）配列の相違

Question

私は13塩基から120塩基あり、保存された領域、それらの間の平均発散または非常に発散する異常値を見つけるためにそれらを比較したい。

問題は、この数のシーケンスで試したことは実行できないということです。

だから誰もこのサイズで似たようなことをしてくれましたし、それを達成するためのヒントをいくつか教えていただけますか？または、私が探すべきちょっとしたヒントでしょうか？

Answer 1

PHYLIPパッケージのdnadistプログラムを使用してください。 Phylipのアライメントフォーマットhereに対処するために、Biopythonライブラリにいくつかの助けがあります。