私は2つの連続変数(小胞および細胞)と、2つのレベル(HC及びRA)を有する単一のグループ化変数で設定単純なデータは、ここでシミュレートした:グループ内の非線形回帰直線とggplot2の合計データをプロットする方法は?
###Simulate Vesicle variable###
Vesicle.hc <- sort(runif(23, 0.98, 5)) #HC group
Vesicle1.ra <- sort(runif(5, 0.98, 3)) #RA group
Vesicle <- c(Vesicle.hc, Vesicle1.ra) #Combined
###Simulate Cells variable###
z <- seq(23)
Cells.hc <- (rnorm(23, 50 + 30 * z^(0.2), 8))*runif(1, 50000, 400000) #HC group
Cells.ra <- c(8.36e6, 6.35e6, 1.287e7, 1.896e7, 1.976e7) #RA group
Cells <- c(Cells.hc, Cells.ra) #Combined
###Define groups and create dataframe###
Group <- rep("HC",23) #HC group
Group1 <- rep("RA",5) #RA Group
Group <- c(Group, Group1) #Combined
df <- data.frame(Cells, Vesicle, Group) #Data frame
Iはデータの散布図をプロットしました使用して、個別に各グループに取り付けられた(hereを示す)、非線形回帰ラインとggplot2を、使用して:
###Plot data###
library(ggplot2)
ggplot(df, aes(x = Cells, y = Vesicle, colour=Group)) +
xlab("Stimulated neutrophils") +
ylab("MV/cell") +
stat_smooth(method = 'nls', formula = 'y~a*exp(b*x)', #Fit nls model
method.args = list(start=c(a=0.1646, b=9.5e-8)), se=FALSE) + #Starting values
geom_point(size=4, pch=21,color = "black", stroke=1.5, aes(fill=Group)) #Change point style
私の質問はどのように私もプロットすることができ、各グループの非線形回帰関数をプロットに加えて、あります回帰直線はに適合データ、すなわち、グループ化変数の寄与を無視したデータのモデル化?
あなたはCells.hc' 'の作成であり、予想外のシンボルを持っています。また、 'z'がどこに作られるのかわかりません。 –
別の 'stat_smooth'を' aes(group = NULL) 'で追加してください。 – Axeman
ああ私の誠実なご謝謝、私は私の仕事の例を作ったとき、私の環境でそれらの変数を既に持っていた - 私はどれほど怠惰です。編集されたコードが機能するはずです。私はあなたの提案@Axemanを試しましたが、エラーはスローされませんが、プロットに変更はありません。 – Hefin