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私はTBSS FSLに取り組んで、3つのグループとグループごとに〜20件のANOVAを作成しています。私のサンプルを分析するために、私は基本的に私のサンプルの中で順列を作るランダムなコマンドを実行する必要があります。FSL（tbss）randomiseコマンドは置換を行いません
コマンドは以下である：
randomise -i all_FA_skeletonised -o tbss -m mean_FA_skeleton_mask -d design.mat -t design.con -f design.fts –e design.grp --T2
design.matマトリックスが異なるグループ内の被験者属性行列であり、design.conは、グループ間の比較を計算し、コントラストの行列であり、 .ftsと.grpはANOVAを作成するために必要なファイルで、fsl内のGLMインタフェースによって与えられます。
私の問題は、私はちょうどコマンドは以下ました、私はANOVAなしt検定をしていたときに私が期待するものをお見せ... FSLが実際になし順列を行うことを
Data loaded
1 permutations required for exhaustive test of f-test 1
Doing all 1 unique permutations
Starting permutation 1 (Unpermuted data)
Critical Value for: tbss_tfce_corrp_fstat1 is: 6.3312e+06
です：
randomise -i all_FA_skeletonised -o tbss -m mean_FA_skeleton_mask -d design.mat -t design.con -n 500 --T2
と端末答えは：
Data loaded
1.10355e+34 permutations required for exhaustive test of t-test 1
Doing 500 random permutations
Starting permutation 1 (Unpermuted data)
Starting permutation 2
Starting permutation 3
...
Starting permutation 500
Critical Value for: tbss_tfce_corrp_tstat1 is: 341255
プログラムはitselによって計算された場合、それがどのように見えますfの必要な順列の数と見つける1.しかし、私は成功のないANOVAのために-n 500コマンドを追加することによって順列の数を強制しようとしました。
私はfsl（tbss）と十分に自信がないので、プログラマが何をしているのか、それがなぜ順列を作らないのか分かりません。誰にも分かりますか？ ご協力いただきありがとうございます。
デザインマトリックスとコントラストファイルの内容を投稿できますか？ –