グラフツールの頂点座標

Question

グラフツールのグラフの頂点の座標を効率的に指定したいと思います。私は

...位置（2.5,3.8）などで1頂点プロットするグラフツールが欲しい

Node,X,Y 

1,2.5,3.8 

2,3.4,2.9 

...

：

は次のようになりますCSVを考えます

非効率的な解は、 Explicit vertex position in python graph-toolで与えられます。したがって、私は基本的にすべての座標に対してforループを使用してプロパティマップ 'pos'に保存することができます。私のグラフは「G」であると私のcsvファイルは、データフレームの座標」でパンダを使用して読み込まれると、私は行うことができます。

for i in range(1,numnodes+1): 
    pos[g.vertex(i)] = (coordinates.values[i-1,1],coordinates.values[i-1,2]) 

を問題があるノードの私の数は、numnodesが大きいこと（〜10^7）これには時間がかかることがあります。

プロパティマップ 'pos'に直接データを入力すると、この操作を効率的に行うことができますか？

Answer 1

を、私はこれを行うための効率的な方法を使用することです、私の質問への答えを見つけました。 set_2d_array（）関数;

pos.set_2d_array(coordinates[['X','Y']].values.T) 

です。 ".T"はnumpyライブラリの一部である転置関数です。

Answer 2

私はこれしようとするだろう：graph-toolはnumpyの配列を受け入れる場合そうでない場合は、

pos = coordinates[['X','Y']].values 

を：

pos = [tuple(t) for t in coordinates[['X','Y']].values]