graph-tool

0熱

2答えて

をインポートすることはできません私はこの問題に対処するために、Googleの利用可能なリンクのすべてを洗い上げてきた、まだそれはまだ私のために未解決のまま... でgraph_toolをインポートしようとしたとき、私は次のエラーを取得しますpython3。私はpython 2.7と3.6とanacondaの両方をインストールしています。 pip、conda、またはbrewのいずれかを使用してパッケ

1熱

1答えて

configure：エラー：CGALライブラリが見つかりません

私の最終的な目標私のシステムとipynbで可能な場合、graph_toolのpythonパッケージを稼働させることです。私はすでにbrew install graph-tool、as indicated hereですが、それでもまだ不十分です。私はAnaconda instructions hereに従っており、CGALライブラリが見つからないようになるまで、まともな進歩を遂げました。 cond

0熱

1答えて

インデックスによる効率的なPythonグラフツールアクセス頂点プロパティ

対応する頂点プロパティを取得する必要がある頂点インデックスのリストがあります。私は、次のコードでそれをやって考えることができます： [graph.vp["label"][ graph.vertex(i) ] for i in indices] それは正常に動作しますが、私はより良い速度を達成するために完全にPythonのループを避けることができますか？私がこれを求めているのは、この特定のコー

0熱

1答えて

graph-tool：プロパティマップ要素をgraphmlに保存する方法は？

これは私の最初の試みは、pythonでグラフツールを使用することです。私はプロパティマップ（名前、トピック、...）にいくつかの重要な情報を持つグラフを持っています。 g.save("test.graphml")を使用してグラフを保存すると、プロパティマップ関連の情報は保存されません。頂点とエッジのみです。その情報も保存する方法が見つかりませんでした。可能ですか？ありがとうございます。

0熱

1答えて

グラフツールgraph_drawプロットカラーバーの伝説

だから私は、グラフを持っていると私は、このコマンドを使用してPDFにこのグラフを描く：今 graph_draw(G_Sub, vertex_fill_color=pr, vertex_size=prop_to_size(pr, mi ...: =5, ma=15), vorder=pr, vcmap=matplotlib.cm.gist_heat, output="G_Sub_pr.

2熱

1答えて

Graph-Tool - > Networkx

Graph-Toolで生成されたグラフを保存し、Networkxで読み取ろうとしています。私はGraphML形式を試しました。残念ながら、私は、プロパティファイルGraphMLのように KeyError: 'vector_float' が発生し、次のように保存されます。 <key id="key1" for="node" attr.name="plot_color" attr.type="ve

0熱

1答えて

graph_toolのプロパティマップはGraphWiewsで動作しますか？

GraphViewオブジェクトのpython graph_toolパッケージは、基本グラフ自体がGraphViewオブジェクトの場合は期待どおりに動作していないようです。問題を示すコードを次に示します。 from graph_tool import * import numpy as np g = Graph() p1 = g.new_vertex_property("bool") gv

0熱

1答えて

頂点を入れ替えると、無向エッジグラフツールからエッジを取り除くことができない

グラフツールのPythonライブラリが初めてで、基本的なことを試しています。 remove_edgeコマンドに問題があります。のコードを取得してみましょう： import graph_tool.all as gt g=gt.Graph(directed=False) v1=g.add_vertex() v2=g.add_vertex() g.add_edge(v1,v2) g.rem

0熱

1答えて

グラフツールライブラリでフィルタリングされたグラフのすべてのフィルタリングされていない頂点を効率的に見つける方法はありますか？

私はグラフ上の病気の伝播モデルを分析するためにグラフツールを使用しています。私は、感染した頂点、つまりその隣人に感染する頂点だけで構成されるフィルタリングされたグラフを作成したいと思います。感染した頂点をフィルタリングすると残りのデータが欠落していますが、私はGraphViewサブクラスを認識していますが、問題は、元のグラフをどこかに保存しておくと、私は頂点の等価物にアクセスすることができず、