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ここにあるクラスタでboostを使ってC++でプログラムを正常にコンパイルしました。シミュレーションを実行するにはSGEスクリプトを実行する必要があります。 libboost_thread.so.1.45.0：いいえそのようなファイルやディレクトリ：は、共有オブジェクトファイルを開くことができませんロードがライブラリを共有しているときにエラー：私は取得エラーは、この ./mainですプログ

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AWKを使ってファイルから行を読み込んで変数を作成する

私はファイル名のリストを持つテキストファイルを持っています。 AWKを使って特定の行番号から変数を作成したいと思います。私が使用して正しい出力を得る： awk "NR==\$Line" /myPath/fileList.txt 私は変数に、この出力を割り当てるとドキュメントから、私は私が仕事に次を期待した： INFILE=$(awk "NR==\$Line" /myPath/fileList.

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再起動ジョブではなくSun Grid Engineのサスペンド

これはクラスタ固有の問題ですが、管理者のみが解決できますが、優先度の低いジョブがあり、優先度が高い場合、プロセスは強制終了されます。高優先度ジョブが終了すると、低優先度ジョブが再開されます。プロセスを強制終了せずに、SIGSTOPなどを介して最初に起動したマシンでサスペンドさせる方法はありますか？残念ながら、チェックポイントはここでのオプションではありませんので、私はメモリ内のものを捨てることな

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SGE-QSUBは-syncモードでジョブをサブミットできません

バイナリプログラムへの入力ファイルを準備し、SGEキューイングシステムバージョン6.2u2にバイナリプログラムの実行を提出するperlスクリプトがあります。ジョブは、親パールスクリプトがwaitpid機能を使用してサブミットされたジョブの状態を監視できるようにするため、-sync yオプションでサブミットされます。親のperlスクリプトにSIGTERMを送信すると、このシグナルが各子に伝播し、

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Sun Grid Engineに環境変数を正しく渡す方法は？

私は一連のジョブをSGEに提出しようとしています（FWIW、一連のGromacs分子動力学シミュレーションです）。input01,input02などの接尾辞を除いてすべてのジョブが同じです。接尾辞が一連のコマンドによって適切に処理されるように実行するコマンドを書いた。しかし、私はexec環境にその変数を受け取る方法を見つけることができません。 qsubのマニュアルページによれば、-v varがそ

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Sun Grid Engineを使用してSMPジョブのノード全体を予約しますか？

Sun Grid Engineを使用するSMP並列環境で実行されるジョブがあります。このコードはよく使われていて、通常正常に動作します。コードはプロセッサ集中型よりもメモリを多く消費しますので、ジョブ自体（送信されたスクリプトで指定されたもの）にはわずかな割合しか使われていなくても、-pe smp 12（12コア/ノード）その。私はSMP並列環境を要求したので、12個のスロットはすべて同じノード

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ユーザープロセスとしてのバッチシステムのHadoop

私はHadoop-on-DemandとSGEのHadoopとの統合を見てきました。私の理解では、大規模なクラスタではない管理者権限が必要です。管理者は手をいっぱいにしており、数か月間私たちを立ち上げることはできません。一時的な仮想クラスタがHDFSのユーティリティを使用するという制限を認識しました。私はまた、光沢ファイルシステムを使用して粒子を嫌うことを理解していますが、hadoopインスタンス

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Condor、Sun Grid Engine、または他の何か？

私は仕事でCondorやSun Grid Engineを試してみるべきかどうかを考えています。多くの場合、未使用のWinXpワークステーションがたくさんあります。私たちがwake-on-LANを使用し、すべてのジョブを実行してから自動的にシャットダウンすることができれば幸いです。 Matlab、Java、Pythonのシミュレーションでは、主にモンテカルロやパラメータの探索を行っています。私の

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SGMAのDRMAA用WebサービスAPI

DRMAA API（ジョブスケジューリングおよび保守API）をSGE（Sun Grid Engine）からWebサービスAPIとして公開するプロジェクトを知っている人はいますか？ RESTfulなAPIが最適です。

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qrshをどのようにラップできますか？

rshと同等のOracle Grid Engineであるqrshのラッパーを作成しようとしていますが、指定されたコマンドを識別できない場合があります。以下の例を考えてみましょう。 qrsh -cwd -V -now n -b y -N cvs -verbose -q some.q -p -98 cvs -Q log -N -S -d2012-04-09 14:02:08 GMT<2012-04-1