parallel-python

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    マップのパラレルバージョン(ppmapラッパー、Kirk Strauserの実装)を使用するといくつか問題があります。 私が並列で実行しようとしている機能は、BioPythonのSeqIOを使用してファイルシステムから解析される多数の文字列(タンパク質配列)に対して簡単な正規表現検索を実行します。各関数呼び出しは、それぞれ独自のファイルを使用します。 ノーマルマップを使用して関数を実行すると、すべ

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    2答えて

    私は現在、研究者が50ノードクラスタで4ヶ月かかると科学計算プロジェクト(確率的なトラクトグラフィー手法described here)が実行されていると聞いて、他のオプションを調べる。プロジェクトは現在、並列Pythonを使用して4Dアレイのチャンクをさまざまなクラスタノードに配信し、処理されたチャンクをまとめて戻します。 私が現在取り組んでいる仕事は、あまりにも粗すぎる(5秒から10分、並列のP

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    私は計算集中型のシミュレーションプログラムを書く必要があります。私はこのプログラムのマルチスレッドバージョンを書こうとしましたが、時間がかかりすぎています。今は複数のノードに展開する予定です(Amazon EC2ノード経由)。 私はすでにPythonに精通しています。私がスピードを気にしていれば、Pythonにはいくつかの並列モジュールが用意されていますか、あるいはErlangのような他のフレーム

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    パラレルPython(pp)モジュールを使用してクラスタを作成しようとしています。 クラスタをセットアップしました。ノードが用意されています ./ppserver.py -p 35000 -i 127.0.0.1 -s "mysecret" マスターも設定され、ジョブが送信されます。 ppservers=("node-1:35000", "node-2:35000") job_server

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    parallelpythonでは、古いシリアルコードをパラレルに変換しようとしています。そのオブジェクトの変数を変更するメソッドを持つオブジェクト。私はシンプルに賛成して構文を省略した剥奪例: class Network: self.adjacency_matrix = [ ... ] self.state = [ ... ] self.equilibria = [