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foreachを含むRパッケージはdoParallelで動作しますがdoMPIでは動作しません。オブジェクトが見つかりません

foreach文とdoMPIバックエンド内に複数のネストされた関数を含むRパッケージを作成しようとしています。 "XXX"オブジェクトエラーを見つけることができません。奇妙なことは、doParallelをバックエンドとして使用するとこのエラーは発生しないということです。大きな問題。このRStudioを使用してR-パッケージにコンパイルされたコードであり、roxygen、デベロッパーツールなど #

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foreach関数内のブール変数値をdoMPIで変更できません

次のmweは、foreach文の中で呼び出され、MPIをバックエンドとして呼び出される一連のネストされた関数を示しています。これらはすべてRパッケージ内にパッケージ化されています。問題は、パッケージを読み込んでfun3を呼び出すと、fun3onの値をTRUEからFALSEに変更できないということです。助言がありますか？完全なコードは https://github.com/jamaas/toymod

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doMPIエラー：アプリケーションで要求された2つのスロットを満たすのに十分なスロットがシステムにありません

私のローカルマシンでdoMPIパッケージを実行しようとしています。クラスタにジョブを提出する。私はMac OSX Yosemiteを使用しており、brewを使ってopen mpi 2.0.2をインストールしています。 mpirun -V mpirun (Open MPI) 2.0.2 Report bugs to http://www.open-mpi.org/community/help/ 私は

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doMPIを使用してログに書き込む

私はHPCでdoMPIを実行しており、ワーカーから出力をログに記録したいと思います。 doParallelを使用して、私はmakeCluster(outfile='myfile.log')を使用することができました。 doMPIでは、いずれのメソッドにもoutfile引数がないようです。私はsinkWorkerOutput()を使ってみました。これは機能しますが、ワーカーの1人だけのログが書き込ま

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foreachループの内部で変数や環境が見つからない関数

nested foreachループ内に最上位関数を含むR packageを構築しようとしています。このトップレベル関数は、さらにネストされた関数のセットを呼び出します。私が持っている問題はレキシカルスコープであり、低レベルの関数は変数や変数を置く環境を見つけることができません。私はこの例ではattachのようにattachを使用しようとしましたが、より低い関数でも必要な引数を見ることができません。