マルチスレッディングでRでシェルスクリプトを実行する

Question

コマンドシステム（）ではRのシェルスクリプト（NCBIのBLAST +）を実行したいが、シェルスクリプトに複数のスレッドを設定してもスレッドは1つしかないようだ。この場合、複数のスレッドを使用するにはどうすればよいですか？

コードは、私がRで16個のコアと、この実行を取得するにはどうすればよい system("blastp -query query.fasta -db db.fasta -num_threads 16 -outfmt \"6 qseqid sseqid pident ppos evalue bitscore qcovs\" -out out.tsv")

のですか？ありがとう！並行して

Answer 1

：4：

library(parallel) 
ncore = 4 

syscall = system("blastp -query query.fasta -db db.fasta -num_threads 16 -outfmt \"6 qseqid sseqid pident ppos evalue bitscore qcovs\" -out out.tsv") 
mclapply(1:ncore,syscall,mc.cores=ncore)