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MPIを使用してHPCクラスタでRを並列実行したいとします。私はパッケージスノウからのmakeCluster関数がノードの数を指定するために使用できることを理解しています。たとえば、makeCluster(2,type="MPI")
は2ノードを意味します。タイプを「MPI」に指定しないと、makeCluster(2)
は1つのノード上に2つのコアを意味します。Rで動作するMPIのコア数とノード数を指定する方法
ノードとコアの数を指定する方法はありますか?
タイプをMPIに指定する場合、デフォルトで各ノードにいくつのコアが使用されますか?