r：ライブラリでのlibsvmファイルの読み込み（e1071）

Question

org.apache.spark.mllib.util.MLUtilsパッケージを使用してscalaでlibsvmファイルを生成しました。次のように

ファイル形式は次のとおり

49.0 109:2.0 272:1.0 485:1.0 586:1.0 741:1.0 767:1.0 
49.0 109:2.0 224:1.0 317:1.0 334:1.0 450:1.0 473:1.0 592:1.0 625:1.0 647:1.0 
681:1.0 794:1.0 
17.0 26:1.0 109:1.0 143:1.0 198:2.0 413:1.0 476:1.0 582:1.0 586:1.0 611:1.0 
629:1.0 737:1.0 
12.0 255:1.0 394:1.0 
etc etc 

Iは次のようにe1071中のパッケージを使用してRにファイルを読み込む：

m= read.matrix.csr(filename) 

次のように得られmatrix.csrの構造は以下の通りである：

$ x:Formal class 'matrix.csr' [package "SparseM"] with 4 slots 
    .. ..@ ra  : num [1:31033] 2 1 1 1 1 1 2 1 1 1 ... 
    .. ..@ ja  : int [1:31033] 109 272 485 586 741 767 109 224 317 334 ... 
    .. ..@ ia  : int [1:2996] 1 7 18 29 31 41 49 65 79 83 ... 
    .. ..@ dimension: int [1:2] 2995 796 
$ y: Factor w/ 51 levels "0.0","1.0","10.0",..: 45 45 10 5 42 25 23 41 23 25 ... 

as.matrix（m）で密行列に変換すると、1つの列と2つの行ea私の中には解釈できないオブジェクトが入っています。

私は単純に（任意の中間処理を行うことなく）ファイルに戻ってmatrix.csrを保存しようとすると、私は次のエラーを取得する：

Error in abs(x) : non-numeric argument to mathematical function

私はLIBSVMフォーマットに互換性がないことを推測していますが、私は」本当にわからない。 ご協力いただければ幸いです。

Answer 1

OK、それの短い：

m= read.matrix.csr(filename)$x 

read.matrix.csrは、2つの要素を持つリストであるからです。行列とベクトル。 つまり、ターゲット/ラベル/クラスはフィーチャマトリックスから切り離されています。仲間のRの初心者のための

注：クラン文書では、「バリュー」小見出しは、関数の戻り値を指しているようです

Value

If the data file includes no y variable, read.matrix.csr returns an object of class matrix.csr,

else a list with components:

x object of class matrix.csr

y vector of numeric values or factor levels, depending on fac