Rでvarclusを使って樹形図を切り取る方法は？

Question

Hmiscのvarclusを使用して、変数のクラスタリングを実行しています（私の変数はすべて数値です）。しかし、私が得たクラスターについてより多くの情報を得る方法は見つけられません。私はcutreeをhclustから試しましたが、動作しませんでした。私が得ることができるクラスタおよびそれらに含まれる変数の 情報のみが木を可視化することであるが、それは非常に便利ではありません...

誰かがvarclusためcutreeよりも同様の機能を知っていますか？変数のクラスタリングを実行する別の関数ですか？ 私は新しいRユーザーですので、どんな助けも大歓迎です！

私はカットしたいデンドログラムの例です。

install.packages('dprep') 
library(dprep) 
library(datasets) 

mxionosphere <- data.matrix(ionosphere) 
v <- varclus(mxionosphere) 
plot(v) 

出力として得られる樹形図をカットしたいと思います。

ありがとうございます！

Answer 1

varclus()にはまだcutree()を使用できますが、最初にhclustオブジェクトを抽出するだけで済みます。 Varclus()を使用して

：あなたはまた、このhclustvar()と機能をClustOfVarパッケージを使用して操作を行うことができ

あなたがちょうど最初vからhclustオブジェクトを抽出する必要があり、cutree機能を使用することができます。これは、varclus()関数で行われたクラスタリングが実際にhclust()によって行われるために機能します。 ？Hmiscを参照してください:: varclus

は、次に、あなたのコードは、以下のように使用することができます。各変数をクラスタ化

library(dprep) 
library(datasets) 
mxionosphere <- data.matrix(ionosphere) 
v <- varclus(mxionosphere) 
groups <- cutree(v$hclust, 10) 

が出力は、それがhclustの場合と同じように、属します。

ClustOfVarパッケージを使用する： （https://cran.r-project.org/web/packages/ClustOfVar/ClustOfVar.pdf）

同様varclus()に、hclustvar()は変数に階層的クラスタリングを実行します。 を使用して、樹状図をkグループに切断することができます。

libary(ClustOfVar) 
h<-hclustvar(mxionosphere) 
clusters<-cutreevar(h, k=10) 
groups<-clusters$cluster ##extract clusters values similar to cutree()