は、Python

Question

に大使館-Phylipnewを使用するためにどのように私はすでに大使館-phylipnew私のシステムでインストールされています。そして、私はそれをPythonでどのように使用するかを考え出しています。私が見つけることができるドキュメントがないという悪いこと。

誰でも使い方を知っていますか？私はこれを使ってPhylipのdnadistと隣人をコマンドラインで実行しようとしています。

Answer 1

ドキュメントがあります：

http://emboss.sourceforge.net/apps/cvs/embassy/phylipnew/

あなたのpythonからそれを使用したい場合は、subprocessモジュールのようなコマンドラインインターフェイスを使用する必要があります。 Biopythonはfneighbor出力形式（Newick）をBio.Phyloというコードで読みやすくしています。