2016-12-01 5 views
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ヒートマップ内のサンプル列を削除して、データを再解析することなく対象外とすることはできますか?例えば、I 'はIL2.OKT3' と 'IL2' との間の上面30差次的に発現される遺伝子を可視化するheatmap.2を使用して、以下のheatmap.2の図を削除しますか?

heatmap

をプロットしました。ヒートマップはすべてのサンプルとドナーに発現パターンを表示しますが、「IL2」と「IL2.OKT3」というラベルのサンプル列のみを表示したいと思います。どんなフィードバックもありがとうございます。

答えて

2

私が知っている唯一の方法は、ヒートマップのプロットに使用したデータマトリックスをサブセット化することです。あなたの行列はmと呼ばれ、あなたは列15-20を取り除きたいされている場合は、

heatmap.2(m[, -(15:20)], ....) 

heatmap.2(m,....)を置き換えると列がプロットされることはありません。

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