Python - PandasのApply関数で値のインデックスを取得する

Question

コード化する必要のあるハプロタイプをコード化する必要があります。私は305行と129902列のパンダのデータフレームにそれらを持って、それはこのようになります（1列のみと20行）：

rs#             rs12914615 
SNPalleles             C/T 
chrom              chr15 
pos             98259206 
strand              + 
genome_build           ncbi_B36 
center            affymetrix 
protLSID  urn:LSID:affymetrix.hapmap.org:Protocol:Genome... 
assayLSID  urn:LSID:affymetrix.hapmap.org:Assay:SNP_A-837... 
panelLSID   urn:lsid:dcc.hapmap.org:Panel:CEPH-30-trios:1 
QC_code              QC+ 
NA06985              CT 
NA06991              CT 
NA06993              CT 
NA06993.dup             CC 
NA06994              CC 
NA07000              CC 
NA07019              CT 
NA07022              CT 

アイデアは、個々の（NA06の値場合と比較することです。.. 。）は、野生型（SNPalleles行の最初の文字）と共通のヌクレオチドを持っているか、そうでなければそれに応じてコードします。

私の疑問は、同じ列の他の行にあるその野生型を参照しながらデータフレームを反復する方法がわからないことです。

出力は次のようになります。

NA06985              1 
NA06991              1 
NA06993              1 
NA06993.dup             0 
NA06994              0 
NA07000              0 
NA07019              1 
NA07022              1 

は0野生型（この遺伝子のCC）、1ヘテロ接合体（CT）と2変異型ホモ接合体（TT）であること。

ありがとうございました。

Answer 1

df.filter(
    like='NA', axis=0 
).eq(df.loc['SNPalleles'].str.replace('/', '')).astype(int) 

      rs12914615 
rs#      
NA06985    1 
NA06991    1 
NA06993    1 
NA06993.dup   0 
NA06994    0 
NA07000    0 
NA07019    1 
NA07022    1