Pyplotの輪郭がxyに沿って反転されます

Question

私は散布図上に多くのデータを持っています。最終結果は数百万点になります。これはスキャッタグラフ上では意味をなさないほどです - ここで説明するように、2Dヒストグラムに変換し、等高線プロットを描きたいhttps://micropore.wordpress.com/2011/10/01/2d-density-plot-or-2d-histogram/

これは私が使用しているコードと似ています。同じ問題

import numpy 
import matplotlib.pyplot as pyplot 

def convert_edges_to_centres(edges): 
    centres = numpy.empty(len(edges)-1) 
    for i in range(len(centres)): 
     centres[i] = (edges[i+1] - edges[i])/2 + edges[i] 
    return centres 

x = numpy.random.normal(0,1,50000) 
print numpy.amin(x),numpy.amax(x) 
y = numpy.random.beta(2,5,50000) 
print numpy.amin(y),numpy.amax(y) 

H,xedges,yedges=numpy.histogram2d(x,y,bins=25) 
xcentres,ycentres=convert_edges_to_centres(xedges),convert_edges_to_centres(yedges) 

print numpy.shape(H) 
print numpy.shape(xedges),numpy.shape(xcentres) 
print numpy.shape(yedges),numpy.shape(ycentres) 

extent = [xedges[0], xedges[-1], yedges[0], yedges[-1]] 

ax = pyplot.axes() 
ax.scatter(x,y) 
ax.contour(H,extent=extent) 

pyplot.show() 

しかし、等高線は、それがおそらくXYに沿って反転しているように見えるflipped-さ：

私は、これはおそらく、簡単に解決されていますが、私は何をうまくすることはできません実現プロ傷ついている！

私も構文pyplot.contour(x,y,z)を使用してプロットしてみましたように私は、中convert_edges_to_centres機能を置くが、それはうまくいきませんでしたどちらか

Answer 1

numpy.histogram2dドキュメントは言う：

ヒストグラムにはないことに注意してくださいx値は縦軸上にあり、y値は縦軸上にあるデカルト規則に従います。むしろ、xは配列の第1の次元（垂直）に沿ってヒストグラムされ、yは配列の第2の次元（水平）に沿ってヒストグラムされる。

がプロットされる前に転置されている例もあります。H = H.Tです。ですから、

ax.contour(H.T,extent=extent)