完全に理解できなかったという根本的な疑問があります。私は5つの独立したグループを持ち、これらのグループ手段のどれが異なるかを知りたがっています。したがって、私は2つの選択肢があります： 1.片方向アノバを行い、ホックテスト（例：Tukey） 2. pairwise.t.testを使用して複数のtテストを行い、次にp値を調整します どちらのアプローチをとるべきですか？これら2つのアプローチの違いは何ですか？複数のグループ比較：anova post hoc testまたはpairwise.t.test？
フォローアップの質問：これらの5つのグループが従属グループ（反復測定）の場合、 これらの比較を行う正しい方法は何ですか？これらのグループが独立している場合との違いはありますか？
鑑定をおねがいします。
どのグループが異なるかについての予測は、先験的なもの（データを見る前に作られたもの）か、事後的なもの（データを見た後にのみ作られるもの）かによって大きく異なります。データの収集を開始する前に、一部のグループが他のグループよりも高いか低いかの特定の予測があった場合は、事前計画されたコントラストを使用する必要があります（一部の条件で単純なt検定に減らすことができます）。
一方、グループの中にはいくつかの違いがあるかもしれないと思っていますが、どちらのグループが分からない場合は、全体的なANOVAを実行してから、修正されたテストを実施してください。 Tukeyのテストや訂正されたp値（Bonferroni）を使ったt検定のようなテストは、統計的に有意な差を考慮するレベルを修正する意味で同じです。違いは、修正を行うために使用された方法にあります。
Bonferroniは複数のテストを修正します。 Tukey（et。al）は複数のテストとテストの事後的な性質を訂正します。
このページは、繰り返し対策でこれを行う方法の質問に役立ちます。David Howell's Page on How to do Multiple Comparisons with Repeated Measures