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JupyterノートブックにRのbioconductor rain packageをインストールしたいと思います。R Jupyterノートブックにバイオコンダクターパッケージ「rain」をインストールすることは可能ですか?

Warning message: 
In install.packages(pkgs = doing, lib = lib, ...): installation of package ‘gmp’ had non-zero exit statusWarning message: 
In install.packages(pkgs = doing, lib = lib, ...): installation of package ‘rain’ had non-zero exit status 

source("https://bioconductor.org/biocLite.R") 
biocLite("rain") 

は、私は次のエラーを取得する:R木星のノートブックで -

は、私は上記のリンク先のウェブサイトの指示に従ってJupyterノートブックでこのパッケージをインストールすることはできませんよジュピター(DESeq2)に次のコマンドラインを使用して、別のバイオコンダクタパッケージをインストールすることができました:

conda install bioconductor-deseq2 

しかし、deseq2とは異なり、雨はアナコンダの雲にはないので、この方法は雨のパッケージでは機能しません。

ジュピターのアナコンダクラウド(レインパッケージのようなもの)にバイオコンダクターパッケージをインストールすることは可能ですか?

ありがとうございました!

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[パッケージ 'xxx'(Rバージョンxyzの場合)を使用することはできません)の警告はどうすればよいですか?](http://stackoverflow.com/questions/25721884/how-should-i-deal – zx8754

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私の問題は、特にJupyter Notebookソフトウェアで使用するためにRパッケージをインストールすることと関係しています。 –

答えて

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私は私の問題の解決策を見つけました。 IRkernelをインストールするには、1)CRAN + Github(手順:http://irkernel.github.io/)と2)をr-irkernelというcondaパッケージとして使用する2つの方法があります。私が使っていた後の方法は、インストール可能なパッケージの機能が限定された、Rのコンドーマント版をインストールして実行します。 CRAN + Githubメソッドを使用すると、Jupyterは、すでにインストールされているRのバージョンを、実行可能なパッケージと共に使用することができます。

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