// [[Rcpp::depends(RcppParallel)]]
#include <RcppParallel.h>
#include <RcppArmadilloExtensions/sample.h>
// [[Rcpp::depends(RcppArmadillo)]]
using namespace Rcpp;
using namespace RcppArmadillo;
using namespace RcppParallel;
using namespace std;
struct Sum : public Worker
{
vector<string> output;
Sum() {}
Sum(const Sum& sum, Split) {}
void operator()(std::size_t begin, std::size_t end) {
vector<string> states;
states.push_back("a");
states.push_back("b");
states.push_back("c");
states.push_back("d");
vector<double> probs;
probs.push_back(0.3);
probs.push_back(0.4);
probs.push_back(0.1);
probs.push_back(0.2);
vector<string> rstat = sample(states, 1, false, wrap(probs));
output.push_back(rstat[0]);
}
void join(const Sum& rhs) {
for(int i=0;i<rhs.output.size();i++) {
output.push_back(rhs.output[i]);
}
}
};
// [[Rcpp::export]]
CharacterVector parallelVectorSum(int n) {
Sum sum;
parallelReduce(0, n, sum);
return wrap(sum.output);
}
上記のコードは、RcppParllel
を学習する単なる実験に過ぎません。私は多くの検索を行い、CharacterVector
,NumericVector
などのデータ型の使用を避けるべきであることを発見しました。そのため私はC++ STL
を使用しています。私はwarninを得た最後の実行でRcppParallelの使用中にスタックの不均衡が発生する
出力1
> parallelVectorSum(1)
[1] "b"
出力2
> parallelVectorSum(11)
[1] "d" "a" "b" "b" "d" "a" "b" "b" "d" "b" "a"
出力3
> parallelVectorSum(111)
Warning: stack imbalance in '.Call', 7 then 6
[1] "a" "b" "d" "b" "a" "b" "d" "d" "a" "b" "a" "b" "d" "b" "b" "c" "a" "a" "a" "d" "b" "b" "b" "a" "c" "a" "b" "a"
[29] "a" "b" "b" "d" "a" "b" "c" "b" "b" "d" "d" "b" "b" "a" "b" "a" "d" "b" "b" "a" "a" "a" "b" "b" "a" "a" "b" "d"
[57] "a" "a" "b" "d" "a" "a" "c" "d" "b" "c" "a" "d" "a" "d" "d" "b" "a" "a" "d" "b" "b" "d" "d" "b" "b" "b" "a" "a"
[85] "c" "a" "b" "d" "c" "b" "b" "a" "d" "d" "b" "b" "a" "a" "d" "d" "a" "c" "b" "b" "a" "a" "b" "b" "b" "c" "d"
gはスタックの不均衡に関連しており、これはsample
という機能の使用がRcppArmadillo
のためであると確信しています。 sample
メソッドの定義では、R
データ型が使用されていることがわかりました。実際にsample
の第4のパラメータはそれ自体問題であるNumericVector
です。
この問題の解決方法は何ですか?私は自分のsample
機能を実装する必要がありますか(私はそれが簡単ではないと思います - 私は初心者です)。 解決方法はありますか?助けてください。
ニース「sample()」の変更をRcppArmadilloに戻す必要がありますか? –
@DirkEddelbuettelはおそらく 'template'をセットアップしてPRが良いでしょう。依存関係の問題? – coatless
軽量からの依存関係は良いでしょう –