ヒートマップのマトリックスをRでグループ化する方法は？

Question

次のようなデータがあります。3つの募集サイト（サイト）と5人の募集年（年）に従って平均睡眠時間（SLP）が表示されるヒートマップを作成します。私が作りたいヒートマップで

SLP site year sex 
8.6 1 2008 1 
7.2 1 2005 2 
6.4 2 2006 2 
9.5 3 2007 2 
6.1 2 2009 2 
5.1 3 2008 1 
2.1 2 2006 2 
3.6 1 2001 1 
8.6 1 2008 1 
7.2 1 2005 2 
6.4 2 2006 2 
9.5 3 2007 2 
6.1 2 2009 2 
5.1 3 2008 1 
2.1 2 2006 2 
3.6 1 2001 1 

、x軸とy軸は今年、サイト、respectivly、各セルです睡眠時間の期間を意味しています。

ヒートマップを作成するためのデータフレームからマトリックスを作成する方法がわかりません。 どうすればいいですか？

Answer 1

多くのオプションがあり、ヒートマップの作成方法にも依存します。 ggplot2を使用する場合は、data.frameを変更する必要はありません。たとえば、次のようになります。

txt <- "SLP site year sex 
8.6 1 2008 1 
7.2 1 2005 2 
6.4 2 2006 2 
9.5 3 2007 2 
6.1 2 2009 2 
5.1 3 2008 1 
2.1 2 2006 2 
3.6 1 2001 1 
8.6 1 2008 1 
7.2 1 2005 2 
6.4 2 2006 2 
9.5 3 2007 2 
6.1 2 2009 2 
5.1 3 2008 1 
2.1 2 2006 2 
3.6 1 2001 1" 

d <- read.table(text = txt, header = TRUE) 
d$year <- factor(d$year) # make year a factor. 

ggplot(d, aes(x = site, y = year, fill = SLP)) + geom_tile()