bashの：2列

Question

に出力関数diffの内容を、私はそうのようなファイルを持っている：

file1.txt 
rs13339951:45007956:T:C 45007956 
rs2838331 45026728 
rs5647 12335 
rs4687576 5353566 

file2.txt 
rs13339951 45007956 
rs2838331 45026728 
rs5647 12335 
rs4687576:ATCFHF 5353566 

詳しい説明：

• は、カラム1の値の一部は、2つのファイル間で同一であり、しかし、column2のではないすべての
• 値は、すべての2つのファイル間で同一である
私は識別したい

2つのファイル間でcolumn1の値が異なる行。私。これらの行1と4は私の例です。 diff file1.txtとfile2.txtでこれを行うことができます。

しかし、このようなエンドファイルを取得したいと思います（下記参照）。実際には、sedを使用して、一方のファイルの名前を他方のファイルの名前に置き換えて、両方のファイルが完全に一致するようにします。

rs13339951:45007956:T:C rs13339951 
rs4687576 rs4687576:ATCFHF 

Answer 1

awkは我々はAWKに2つのファイルを渡しているこの

awk 'FNR==NR {a[$2]=$1; next} a[$2]!=$1 {print a[$2] " " $1}' file1 file2 

出力

rs13339951:45007956:T:C rs13339951 
rs4687576 rs4687576:ATCFHF 

---

に最適です。それはそれらを連続して通過します。

FNR==NR {.... next} { ... } 

この「トリック」では、最初のファイルに対して最初のアクションが実行され、2番目のファイルに対して2番目のアクションが実行されます。

a[$2]=$1 

キー値ルックアップテーブル。 2番目の列はキーの最初の列は値です。このルックアップテーブルは、最初のファイルを読み込みながら作成します。

a[$2]!=$1 {print a[$2] " " $1} 

2番目のファイルを反復処理している間は、現在の最初の列とルックアップテーブルの値を比較します。一致しない場合は、目的の出力を印刷します。