チェック重複列とbashの

Question

で別で印刷こんにちは私は怒鳴るの例でこれを実行する必要があります。

入力ファイル：

chr17 41246351 41246352 NM_007294_Exon_10 
chr17 41246351 41246352 NM_007297_Exon_9 
chr17 41246351 41246352 NM_007300_Exon_10 
chr17 41246351 41246352 NR_027676_Exon_10 
chr17 41246352 41246353 NM_007294_Exon_10 
chr17 41246352 41246353 NM_007297_Exon_9 
chr17 41246352 41246353 NM_007300_Exon_10 

このような出力を取得：

chr17 41246351 41246352 NM_007294_Exon_10,NM_007297_Exon_9,NM_007300_Exon_10,NR_027676_Exon_10 
chr17 41246352 41246353 NM_007294_Exon_10,NM_007297_Exon_9,NM_007300_Exon_10 

を私がしましたuniqとsortを使用しようとしましたが、成功しませんでした。何か助けてくれてありがとう。

Answer 1

あなたはこのawk使用することができます：カンマ区切りとして、あなたが最後の列をしたい場合は

awk '{i=$1 FS $2 FS $3} {a[i]=!a[i]?$4:a[i] FS $4} END {for (l in a) {print l,a[l]}}' file 

を、

awk '{i=$1 FS $2 FS $3} {a[i]=!a[i]?$4:a[i] "," $4} END {for (l in a) {print l,a[l]}}' file 

Answer 2

はAWKを使用しよう：

awk '!seen[$2]++' testfile 

・ホープ、このことができます！

Answer 3

$ perl -ne '($k,$v)=/^(.*\s)(\S+)$/; $h{$k} .= "$v,"; 
      END{print "$_$h{$_}\n" foreach keys %h }' ip.txt 
chr17 41246351 41246352 NM_007294_Exon_10,NM_007297_Exon_9,NM_007300_Exon_10,NR_027676_Exon_10, 
chr17 41246352 41246353 NM_007294_Exon_10,NM_007297_Exon_9,NM_007300_Exon_10, 

これは... sed 's/,$//'

を使用して削除したり、必要に応じてカンマを追加することが条件?:（awkの溶液中で@satで使用されるロジックに類似）を使用することができるが、末尾,を残し、必要ありません。後処理を後処理するための後処理

$ perl -ne '($k,$v)=/^(.*\s)(\S+)$/; $h{$k} .= $h{$k}?",$v":"$v"; 
      END{print "$_$h{$_}\n" foreach keys %h }' ip.txt