2017-06-29 31 views
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ggplot2を使用して1つのプロットに複数のROC曲線をプロットしようとしています。異なるレイヤーでggplot2を使用して複数のROC曲線をプロットする

ggroc2 <- function(columns, data = mtcars, classification = "am", 
        interval = 0.2, breaks = seq(0, 1, interval)){ 
    require(pROC) 
    require(ggplot2) 

    #The frame for the plot 
    g <- ggplot() + geom_segment(aes(x = 0, y = 1, xend = 1,yend = 0)) + 
    scale_x_reverse(name = "Specificity",limits = c(1,0), breaks = breaks, 
expand = c(0.001,0.001)) + 
    scale_y_continuous(name = "Sensitivity", limits = c(0,1), breaks = 
breaks, expand = c(0.001, 0.001)) + 
    theme_classic() + coord_equal() 

    #The loop to calculate ROC's and add them as new layers 
    for(i in 1:length(columns)){ 
    croc <- roc(data[,classification], data[,columns[i]]) 
    plotx <- rev(croc$specificities) 
    ploty <- rev(croc$sensitivities) 
    g <- g + geom_step(aes(x=plotx, y=ploty)) 
    } 

    g 
} 



#Sample graph 
ggroc2(c("mpg", "disp", "drat", "wt")) 

問題がcolumnsリスト内の唯一の最後のパラメータがプロットされることをである:ここで私が得たどのくらいです。私は問題がthe answer to this questionの後にaes()と怠惰な評価に関連していなければならないと特定しました。この例ではgeom_segment()を使用しており、問題は、aes()をすべて削除して解決しました。私は何とかデータをマップする必要があるので、私にとってはうまくいかない。ここでaes()を削除すると、何もプロットされません。 geom_の怠惰な評価問題を回避するには、どうすればaes()に依存しますか?

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[この回答](https://stackoverflow.com/a/15988472/2461552)が回避策として、変数名と 'aes_string'を用いて示しています。 – aosmith

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重複している問題については、指摘していただきありがとうございます。私は「それは私の問題を解決しました!」をクリックすべきかどうかを判断しようとしています。 「どのように説明するかを編集する」ボタンをクリックします。私の質問は本当に重複しているようですが、私は長い形式にデータを再形成するよりも、はるかにエレガントで効率的な回避策であると答えています。私は何をすべきか? – naco

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私が重複と他の重複を選択した理由の1つは、 'data.frame'の回避策を示していることです。ここでの答えは同じアプローチを使用しています。 – aosmith

答えて

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ここにコードの有効バージョンがあります。
最終的なグラフィック結果があまり良くないため、改善する必要があります。

ggroc2 <- function(columns, data = mtcars, classification = "am", 
        interval = 0.2, breaks = seq(0, 1, interval)){ 
    require(pROC) 
    require(ggplot2) 

    #The frame for the plot 
    g <- ggplot() + geom_segment(aes(x = 0, y = 1, xend = 1,yend = 0)) + 
    scale_x_reverse(name = "Specificity",limits = c(1,0), breaks = breaks, 
expand = c(0.001,0.001)) + 
    scale_y_continuous(name = "Sensitivity", limits = c(0,1), breaks = 
breaks, expand = c(0.001, 0.001)) + 
    theme_classic() + coord_equal() 

    #The loop to calculate ROC's and add them as new layers 
    cols <- palette() 
    for(i in 1:length(columns)){ 
    croc <- roc(data[,classification], data[,columns[i]]) 
    sens_spec <- data.frame(spec=rev(croc$specificities), 
          sens=rev(croc$sensitivities)) 
    g <- g + geom_step(aes(x=spec, y=sens), data=sens_spec, col=cols[i], lwd=1) 
    } 
    g 
} 

#Sample graph 
ggroc2(c("mpg", "disp", "drat", "wt")) 

enter image description here

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"最終的なグラフィカルな結果はそれほど良くなく、改善されるはずです。"あなたは重複する行を指していますか?とにかく、非常に実証的な答え、ありがとう。私はそれを非常にはっきりと理解する。それをここからさらに取り除くのは簡単なはずです。 – naco

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@nacoはい、私は重複する行が好きではありません。とにかく、私はあなたが私の答えが役に立つのを発見してうれしいです! –

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