matplotlibの等高線図を再描画する速度を向上させる

Question

ファイルからのデータをそのテキストファイルの各行の等高線図としてプロットするPythonプログラムがあります。現在、私のインターフェースには3つの別々の等高線図があります。私がファイルからデータを読み込んだり、スクリプトを実行する前にメモリにロードしても輪郭プロットから〜6fpsしか得ることはできません。

私はまた1輪郭だけを使って試してみましたが、残りは通常のプロットですが、速度は7fpsに増加しました。私はそれが数行を描くことに計算上課税しているとは思わない。実質的に速くする方法はありますか？理想的には、少なくとも30fpsを得ることは理想的です。

私は輪郭を描く方法は、私のデータの各行のために、私は以前のものを削除することです：

for coll in my_contour[0].collections: 
    coll.remove() 

とコードの先頭に新しい1

my_contour[0] = ax[0].contour(x, y, my_func, [0]) 

を追加し、私はplt.ion()を追加してプロットを更新しています。

ご協力いただければ幸いです。ここで

おかげ

Answer 1

はアニメーションでcontourプロットを使用する方法の例です。それは、blitをオンまたはオフにするのを容易にするmatplotlib.animation.FuncAnimationを使用します。 blit = Trueの場合、私のマシン上で~64 fpsで実行され、〜55 fpsでblitせずに実行されます。もちろん、intervalは高速アニメーションを可能にする必要があります。 interval=10（ミリ秒）に設定すると、最大100fpsが可能になりますが、描画時間はそれよりも遅いものに制限されます。

import matplotlib.pyplot as plt 
import matplotlib.animation 
import numpy as np 
import time 

x= np.linspace(0,3*np.pi) 
X,Y = np.meshgrid(x,x) 
f = lambda x,y, alpha, beta :(np.sin(X+alpha)+np.sin(Y*(1+np.sin(beta)*.4)+alpha))**2 
alpha=np.linspace(0, 2*np.pi, num=34) 
levels= 10 
cmap=plt.cm.magma 


fig, ax=plt.subplots() 
props = dict(boxstyle='round', facecolor='wheat') 
timelabel = ax.text(0.9,0.9, "", transform=ax.transAxes, ha="right", bbox=props) 
t = np.ones(10)*time.time() 
p = [ax.contour(X,Y,f(X,Y,0,0), levels, cmap=cmap) ] 

def update(i): 
    for tp in p[0].collections: 
     tp.remove() 
    p[0] = ax.contour(X,Y,f(X,Y,alpha[i],alpha[i]), levels, cmap= cmap) 
    t[1:] = t[0:-1] 
    t[0] = time.time() 
    timelabel.set_text("{:.3f} fps".format(-1./np.diff(t).mean())) 
    return p[0].collections+[timelabel] 

ani = matplotlib.animation.FuncAnimation(fig, update, frames=len(alpha), 
             interval=10, blit=True, repeat=True) 
plt.show() 

画像を保存するプロセスは少し時間がかかるので、アニメーションGIFに遅いフレームレートが、示されている上にあることに注意してください。