2017-02-03 7 views
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SparkRデータフレームのすべての列で欠損値のクロス集計に関心があります。SparkRデータフレームの欠損値をすべての列でクロス集計します

データ、私はflatMapを使用して、所望の解に到達したいthis answerに続いて

set.seed(2) 

# Create basic matrix 
M <- matrix(
    nrow = 100, 
    ncol = 100, 
    data = base::sample(x = letters, size = 1e4, replace = TRUE) 
) 


## Force missing vales 
M[base::sample(1:nrow(M), 10), 
    base::sample(1:ncol(M), 10)] <- NA 
table(is.na(M)) 

SparkR

:私は利用しようとしているデータは、以下のコードを使用して生成することができます。考え方は、欠損値/欠損値をT/Fに置き換えて、各変数のオカレンスをカウントすることです。まず、それはflatMapは何SparkR 2.1によってエクスポートされたことが表示されませんので、私は、コードを実行した後、:::

# Import data to SparkR --------------------------------------------------- 

# Feed data into SparkR 
dtaSprkM <- createDataFrame(sqc, as.data.frame(M)) 
## Preview 
describe(dtaSprkM) 
# Missing values count ---------------------------------------------------- 

# Function to convert missing to T/F 
convMiss <- function(x) { 
    ifelse(test = isNull(x), 
      yes = FALSE, 
      no = TRUE) 
} 

# Apply 
dtaSprkMTF <- SparkR:::flatMap(dtaSprkM, isNull) 
## Derive data frame 
dtaSprkMTFres <- createDataFrame(sqc, dtaSprkMTF) 

セカンドでそれを掘る必要があった次のエラーメッセージで失敗します

Error in (function (classes, fdef, mtable) : 
    unable to find an inherited method for function ‘isNull’ for signature ‘"list"’ 

希望結果

Rの通常のデータフレームでは、次のようにして目的の結果が得られます。

sapply(as.data.frame(M), function(x) { 
    prop.table(table(is.na(x))) 
}) 

は私がtableprop.table提供し、理想的には私がSparkR経由で同様の柔軟性に到着できるようにしたいと柔軟性が好き。

答えて

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列ごと NULL

計算フラクション:

fractions <- select(dtaSprkM, lapply(columns(dtaSprkM), function(c) 
    alias(avg(cast(isNotNull(dtaSprkM[[c]]), "integer")), c) 
) 

これはtidyrと、例えば、安全に収集され、容易に局所的に再形成することができる単一行Data.Frameを作成します。

library(tidyr) 

fractions %>% as.data.frame %>% gather(variable, fraction_not_null) 
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