3D画像のサイズ変更（およびリサンプリング）

Question

私は脳の3D画像を持っています（それをフラッシュと呼ぶ）、現在は263×256×185です。別の画像のサイズにリサイズしたいのですが（whole_brain_bravoと呼んでください） ; 256 x 256 x 176、および（うまくいけば）再サンプリングするためにlanczos補間を使う（Image.ANTIALIAS）。私の（失敗した）試み：

from scipy import ndimage as nd 
import nibabel as nib 
import numpy as np 



a = nib.load('flash.hdr') # nib is what I use to load the images 
b = nib.load('whole_brain_bravo.hdr') 

flash = a.get_data() # Access data as array (in this case memmap) 
whole = b.get_data() 

downed = nd.interpolation.zoom(flash, zoom=b.shape) # This obviously doesn't work 

あなたはこれまで3D画像でこのようなことをやったことがありますか？二つの画像間のスケールファクタで何

""" 
zoom : float or sequence, optional 
    The zoom factor along the axes. If a float, `zoom` is the same for each 
    axis. If a sequence, `zoom` should contain one value for each axis. 
""" 

：scipy.ndimage.interpolate.zoomのdocstringから

Answer 1

？すべての軸で一定ですか（つまり、等倍でスケーリングしていますか？）その場合、zoomは単一の浮動小数点値でなければなりません。それ以外の場合は、軸ごとに1つの浮動小数点数のシーケンスでなければなりません。 wholeとflashの物理的な寸法は等しいと仮定できる場合たとえば

、は、その後、あなたがこのような何か行うことができます：ドキュメントによると

dsfactor = [w/float(f) for w,f in zip(whole.shape, flash.shape)] 
downed = nd.interpolation.zoom(flash, zoom=dsfactor) 

Answer 2

を、zoom引数は「軸に沿ってズームファクタ "を選択します。これは少し曖昧ですが、希望の次元ではなくスケールファクタを意味するように思えます。

これを試してみてください：フィルタの選択について

zoomFactors = [bi/float(ai) for ai, bi in zip(a, b)] 
downed = nd.interpolation.zoom(flash, zoom=zoomFactors) 

わからない - ドキュメントは、様々な注文のスプライン補間を言及。