scopy/pandasでPearsonのrで 'nan'をドロップする

簡単な質問：scipyでPearsonのr関数で 'dropna'を使う方法はありますか？私はパンダと組み合わせて使用しています。私のデータの中には穴があります。私はあなたがSpearmanのrでolder versions of scipyの 'nan'を抑制できると知っていましたが、その機能は現在失われています。scopy/pandasでPearsonのrで 'nan'をドロップする

私の考えによれば、これはほのぼの改善のように思えるので、明らかに何かが欠けているのだろうかと思います。

マイコード：

for i in range(len(frame3.columns)):  
    correlation.append(sp.pearsonr(frame3.iloc[ :,i], control['CONTROL']))

出典

2016-08-11 Lodore66

はい、あなたはそれに 'dropna'を使うことができます。あなたの質問は何ですか？ –

本当ですか？追加するたびにインデックスエラーが発生します。上記のコードを追加しました。それを置くための適切な場所はどこですか？ – Lodore66

* "...その機能は現在欠落しています。" *あなたは 'nan_policy'引数を参照していますか？それはまだ「スピアマン」です。実際、「古いバージョン」と呼ばれるリンクは、最新のリリース0.18.0のドキュメントです。どのバージョンを使用していますか？ 'import scipy;を実行してチェックしてください。 print（scipy .__バージョン__） ' –

あなたはこのようnp.isnanを使用することができます。

for i in range(len(frame3.columns)):  
    x, y = frame3.iloc[ :,i].values, control['CONTROL'].values 
    nas = np.logical_or(x.isnan(), y.isnan()) 
    corr = sp.pearsonr(x[~nas], y[~nas]) 
    correlation.append(corr)

出典

2016-08-11 11:23:24

素晴らしい！これはうまく動作します。本当にありがとう！ – Lodore66

ようこそ。がんばろう。 –

ます。また、一時的なデータフレームを作成してみてください、そして内蔵のピアソン相関を計算するための方法、または使用パンダを使用することができます一時的なデータフレーム内の.dropnaメソッドは、sp.pearsonrを使用する前にヌル値をドリルアップします。

出典

2017-03-16 22:02:48

これは、参加についていくつかの仮定をしています。例えば、インデックスは互換性があります –

scopy/pandasでPearsonのrで 'nan'をドロップする

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