2016-09-27 7 views
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にだらしないとアンバランスなデータセットを再成形私はこのようになりますデータセット(データ)があります。広いから長い

ID,ABC.BC,ABC.PL,DEF.BC,DEF.M,GHI.PL 
SB0005,C01,D20,C01a,C01b,D20 
BC0013,C05,D5,C05a,NA,D5 

が、私はこのような何かを得るために広いツー長い形式から、それを再構築したい:

ID,FC,Type,Var 
SB0005,ABC,BC,C01 
SB0005,ABC,PL,D20 
SB0005,DEF,BC,C01a 
SB0005,DEF,M,C01b 
SB0005,GHI,PL,D20 
BC0013,ABC,BC,C05 
BC0013,ABC,PL,D5 
BC0013,DEF,BC,C05a 
# BC0013,DEF,M,NA (This row need not be in the dataset as I will remove it later) 
BC0013,GHI,PL,D5 

データセットがアンバランスであるため、通常のリシェイプパッケージは機能しません。私もsplitstackshapeからReshapeを試しましたが、それは私に欲しいものを与えません。

library(splitstackshape) 
vary <- grep("\\.BC$|\\.PL$|\\.M$", names(data)) 
stubs <- unique(sub("\\..*$", "", names(data[vary]))) 
Reshape(data, id.vars=c("ID"), var.stubs=stubs, sep=".") 

ID,time,ABC,DEF,GHI 
SB0005,1,C01,C01a,D20 
BC0013,1,C05,C05a,D5 
SB0005,2,D20,C01b,NA 
BC0013,2,D5,NA,NA 
SB0005,3,NA,NA,NA 
BC0013,3,NA,NA,NA 

ありがとうございます!

あなたが最初の長い形式にデータを再構築する必要が

structure(list(ID = structure(c(2L, 1L), .Label = c("BC0013", 
"SB0005"), class = "factor"), ABC.BC = structure(1:2, .Label = c("C01", 
"C05"), class = "factor"), ABC.PL = structure(1:2, .Label = c("D20", 
"D5"), class = "factor"), DEF.BC = structure(1:2, .Label = c("C01a", 
"C05a"), class = "factor"), DEF.M = structure(1:2, .Label = c("C01b", 
"NA"), class = "factor"), GHI.PL = structure(1:2, .Label = c("D20", 
"D5"), class = "factor")), .Names = c("ID", "ABC.BC", "ABC.PL", 
"DEF.BC", "DEF.M", "GHI.PL"), row.names = c(NA, -2L), class = "data.frame") 
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'dput(データ)の出力を入力してください'で私たちはあなたの努力を再現することができます。 – Chrisss

+0

どのようにアンバランスですか?あなたは落としたい「NA」を意味しますか?また、期待される出力の最後の行は 'D20'ではなく' D5'を持っていますか? –

+0

あなたが正しいです、私はエラーのおかげで修正しました。 BC、PL、MはすべてのFCには表示されないため、バランスがとれていません。 BCはABCとDEFに現れ、GHIには現れません。 – phusion

答えて

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要求としてdput(data)の出力を提供し、その後、あなたは、列に変数に列を吐くことができます。 splitstackshapeとあなたができる:

になり
library(splitstackshape) # this will also load 'data.table' from which the 'melt' function is used 
cSplit(melt(mydf, id.vars = 'ID'), 
     'variable', 
     sep = '.', 
     direction = 'wide')[!is.na(value)] 

      ID value variable_1 variable_2 
1:     SB0005 C01  ABC   BC 
2:     BC0013 C05  ABC   BC 
3:     SB0005 D20  ABC   PL 
4:     BC0013 D5  ABC   PL 
5:     SB0005 C01a  DEF   BC 
6:     BC0013 C05a  DEF   BC 
7:     SB0005 C01b  DEF   M 
8:     SB0005 D20  GHI   PL 
9:     BC0013 D5  GHI   PL 

tidyrとの代替を:

library(tidyr) 
mydf %>% 
    gather(var, val, -ID) %>% 
    separate(var, c('FC','Type')) %>% 
    filter(!is.na(val)) 
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