重心から多次元空間内の点の距離を計算するにはどうすればよいですか

Question

私はcentroid<-c(-0.0160560385542169, -0.0125691807228916, -0.000605079518072289, -0.00174781445783133, -0.0199511518072289)として与えられた5次元の空間の重心を持っています。私はまた、PCA1:PCA5がそれらのサンプルの点の5次元を表す5つのサンプルを有する行列を有する。これらのサンプルの重心からユークリッド距離をどのようにして計算できますか？ある点から別の点までの距離であれば、単純にdist(mymat[,-1])を実行することができましたが、重心からの距離をどのように得ることができるかわかりません。誰かがお勧めしますか？

mymat<- structure(c("10687:G41F", "10687:SKDP-225.3", "10687:2671", "10687:LPH-001-16_SCC", 
"10687:MC1R-694CB-T", "-0.0039950", "-0.0203415", "-0.0200395", 
"-0.0147320", "-0.0196970", "-0.0140180", "-0.0181240", "-0.0165090", 
"-0.0148700", "-0.0170765", "-0.0136615", "-0.0010915", "-0.0014500", 
" 0.0020240", "-0.0021095", "-0.0002395", "-0.0019710", "-0.0017595", 
" 0.0036180", "-0.0036255", "-0.0184015", "-0.0197400", "-0.0238185", 
"-0.0282375", "-0.0323130"), .Dim = 5:6, .Dimnames = list(c("1", 
"2", "3", "4", "5"), c("samples", "PCA1", "PCA2", "PCA3", 
"PCA4", "PCA5"))) 

Answer 1

distが、それはスペース（私が何をしたい何か）の重心からこれらの点の距離が異なるない

centroid <- c(-0.0160560385542169, -0.0125691807228916, -0.000605079518072289, 
-0.00174781445783133, -0.0199511518072289) 
rbind(c("centroid", centroid), mymat) -> k 
dist(k, "euclidean") -> dd 
as.matrix(dd) -> dd 
k[,1] -> rownames(dd) 
as.data.frame(dd) 
dd[2:6,1] -> dist_to_centroid 
View(as.data.frame(dist_to_centroid))