R：ヒートマップ2色変更キー

Question

パッケージgplotsについてご不明な点があります。私は機能heatmap.2を使用したいので、私は0から1です。通常symkey=TRUEにカラーキーの私の対称の点を変更したいとあなたは色がこのように管理され、カラーバーが作成されcol=redgreen()使用：

red = -2 to -0.5 
black=-0.5 to 0.5 
green= 0.5 to 2 

今、私はこのようなカラーバーを作成します：

red= -1 to 0.8 
black= 0.8 to 1.2 
green= 1.2 to 3 

は、この可能性のようなものですか？

ありがとうございました！

Answer 1

the heatmap.2 help fileを見ると、breaks引数が必要なようです。ブレークポイントが等間隔に配置される場合には色にXをビニングするための分割点、または使用されるブレークポイントの整数を示す

breaks（オプション）のいずれかの数値ベクトル、：ヘルプファイルから

したがって、breaksを使用して各色のカットオフポイントを指定します。例：

library(gplots) 

# make up a bunch of random data from -1, -.9, -.8, ..., 2.9, 3 
# 10x10 
x = matrix(sample(seq(-1,3,by=.1),100,replace=TRUE),ncol=10) 

# plot. We want -1 to 0.8 being red, 0.8 to 1.2 being black, 1.2 to 3 being green. 
heatmap.2(x, col=redgreen, breaks=c(-1,0.8,1.2,3)) 

重要なビットは、あなたのカットオフであるbreaks=c(-1,0.8,1.2,3)です。