私はIntelの数学カーネルライブラリ（mkl）のルーチンを使用するpython c拡張を書きました。これは、私がc拡張を書くのは初めてです。私はちょうど今日それを学んだ。Python用のcエクステンションに外部共有intelのmklライブラリを含む
コンパイルされたc拡張子。しかし、Pythonでインポートすると、未定義のシンボルが表示され、mklで定義されている関数を見つけることができません。
外部CライブラリをPythonの拡張子に含めるにはどうすればいいですか？
ありがとうございました。
mkl_helper.c：
#include "Python.h"
#include "numpy/arrayobject.h"
#include "mkl.h"
static PyObject* test4 (PyObject *self, PyObject *args)
{
// test4 (m, n,
// a, ja, ia,
// c, jc, ic)
PyArrayObject *shape_array;
PyArrayObject *a_array; // csr_matrix.data
PyArrayObject *ja_array; // csr_matrix.indices
PyArrayObject *ia_array; // csr_matrix.indptr
PyArrayObject *c_array;
PyArrayObject *jc_array;
PyArrayObject *ic_array;
if (!PyArg_ParseTuple(args, "O!O!O!O!O!O!O!",
&PyArray_Type, &shape_array,
&PyArray_Type, &a_array,
&PyArray_Type, &ja_array,
&PyArray_Type, &ia_array,
&PyArray_Type, &c_array,
&PyArray_Type, &jc_array,
&PyArray_Type, &ic_array))
{
return NULL;
}
long * ptr_int = shape_array->data;
int m = ptr_int[0];
int n = ptr_int[1];
int k = n;
float * a_data_ptr = a_array->data;
float * ja_data_ptr = ja_array->data;
float * ia_data_ptr = ia_array->data;
float * c_data_ptr = c_array->data;
float * jc_data_ptr = jc_array->data;
float * ic_data_ptr = ic_array->data;
char trans = 'T';
int sort = 0;
int nzmax = n*n;
int info = -3;
int request = 0;
mkl_scsrmultcsr(&trans, &request, &sort,
&m, &n, &k,
a_data_ptr, ja_data_ptr, ia_data_ptr,
a_data_ptr, ja_data_ptr, ia_data_ptr,
c_data_ptr, jc_data_ptr, ic_data_ptr,
&nzmax, &info);
return PyInt_FromLong(info);
}
static struct PyMethodDef methods[] = {
{"test4", test4, METH_VARARGS, "test2(arr1)\n take a numpy array and return its shape as a tuple"},
{NULL, NULL, 0, NULL}
};
PyMODINIT_FUNC
initmkl_helper (void)
{
(void)Py_InitModule("mkl_helper", methods);
import_array();
}
setup.py：
from distutils.core import setup, Extension
import numpy as np
ext_modules = [ Extension('mkl_helper', sources = ['mkl_helper.c']) ]
setup(
name = 'mkl_helper',
version = '1.0',
include_dirs = [np.get_include()], #Add Include path of numpy
ext_modules = ext_modules
)
test.py：実行test.pyの
import mkl_helper
結果：
Traceback (most recent call last):
File "<string>", line 1, in <module>
ImportError: /home/rxu/local/lib/python2.7/site-packages/mkl_helper.so: undefined symbol: mkl_scsrmultcsr
アップデート2016年6月16日：
これは有用であると思わ：
1.12。 https://docs.python.org/2/extending/extending.htmlに拡張モジュールのC APIを提供すると、別のc拡張モジュールに1つのc拡張を含めても、共有ライブラリとしてリンクすると問題が発生する可能性があります。だから、私は静的ライブラリとしてmklをリンクする必要がありますね？または、inlcude mkl.hをpython.hに追加しますか？
しかし、私はctypes.cdll.LoadLibrary（ "./ mkl_rt.so"）を使ってmklの共有ライブラリを読み込み、問題なく共有ライブラリのc関数を使用することができます。 here）。しかし、Python/CのAPIはCで同じことをすることはできません？静的に外部のCライブラリをリンクするため、setup.pyが必要になる場合があります
：応答なしとcythonについてhttps://docs.python.org/2/distutils/apiref.html?highlight=include#distutils.ccompiler.CCompiler.add_include_dir
関連質問でクラスdistutils.core.Extensionsで 余分なオブジェクト：Combining Cython with MKL
この1つは思わより有用：廃止されましたPython, ImportError: undefined symbol: g_utf8_skip
この1つのユースのdlopen：でUndefined Symbol in C++ When Loading a Python Shared Library